Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Treml4Q3LRV9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Treml4Q3LRV9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Treml4Q3LRV9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Treml4Q3LRV9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Treml4Q3LRV9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Treml4Q3LRV9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Treml4Q3LRV9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Treml4Q3LRV9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Treml4Q3LRV9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Treml4Q3LRV9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Treml4Q3LRV9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Treml4Q3LRV9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Treml4Q3LRV9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Treml4Q3LRV9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Treml4Q3LRV9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Treml4Q3LRV9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Treml4Q3LRV9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Treml4Q3LRV9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Treml4Q3LRV9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Treml4Q3LRV9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Treml4Q3LRV9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Treml4Q3LRV9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Treml4Q3LRV9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Treml4Q3LRV9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Treml4Q3LRV9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Treml4Q3LRV9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Treml4Q3LRV9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Treml4Q3LRV9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Treml4Q3LRV9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Treml4Q3LRV9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Treml4Q3LRV9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Treml4Q3LRV9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Treml4Q3LRV9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Treml4Q3LRV9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Treml4Q3LRV9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Treml4Q3LRV9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Treml4Q3LRV9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Treml4Q3LRV9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Treml4Q3LRV9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Treml4Q3LRV9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Treml4Q3LRV9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Treml4Q3LRV9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Treml4Q3LRV9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Treml4Q3LRV9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Treml4Q3LRV9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Treml4Q3LRV9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Treml4Q3LRV9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Treml4Q3LRV9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Treml4Q3LRV9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Treml4Q3LRV9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Treml4Q3LRV9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Treml4Q3LRV9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Treml4Q3LRV9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Treml4Q3LRV9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Treml4Q3LRV9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Treml4Q3LRV9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Treml4Q3LRV9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Treml4Q3LRV9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Treml4Q3LRV9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Treml4Q3LRV9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Treml4Q3LRV9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Treml4Q3LRV9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Treml4Q3LRV9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Treml4Q3LRV9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Treml4Q3LRV9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Treml4Q3LRV9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Treml4Q3LRV9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Treml4Q3LRV9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Treml4Q3LRV9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Treml4Q3LRV9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Treml4Q3LRV9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Treml4Q3LRV9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Treml4Q3LRV9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Treml4Q3LRV9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Treml4Q3LRV9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Treml4Q3LRV9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Treml4Q3LRV9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Treml4Q3LRV9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Treml4Q3LRV9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Treml4Q3LRV9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Treml4Q3LRV9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Treml4Q3LRV9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Treml4Q3LRV9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Treml4Q3LRV9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Treml4Q3LRV9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Treml4Q3LRV9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Treml4Q3LRV9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Treml4Q3LRV9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Treml4Q3LRV9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Treml4Q3LRV9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Treml4Q3LRV9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Treml4Q3LRV9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Treml4Q3LRV9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Treml4Q3LRV9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Treml4Q3LRV9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Treml4Q3LRV9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Treml4Q3LRV9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Treml4Q3LRV9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Treml4Q3LRV9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms