Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NREPQ16612 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NREPQ16612 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NREPQ16612 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NREPQ16612 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NREPQ16612 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NREPQ16612 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NREPQ16612 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NREPQ16612 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NREPQ16612 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NREPQ16612 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NREPQ16612 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NREPQ16612 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NREPQ16612 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NREPQ16612 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NREPQ16612 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NREPQ16612 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NREPQ16612 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NREPQ16612 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NREPQ16612 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NREPQ16612 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NREPQ16612 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NREPQ16612 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NREPQ16612 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NREPQ16612 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NREPQ16612 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NREPQ16612 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NREPQ16612 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NREPQ16612 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NREPQ16612 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NREPQ16612 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NREPQ16612 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NREPQ16612 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NREPQ16612 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NREPQ16612 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NREPQ16612 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NREPQ16612 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NREPQ16612 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NREPQ16612 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NREPQ16612 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NREPQ16612 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NREPQ16612 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NREPQ16612 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NREPQ16612 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NREPQ16612 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NREPQ16612 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NREPQ16612 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NREPQ16612 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NREPQ16612 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NREPQ16612 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NREPQ16612 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NREPQ16612 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NREPQ16612 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NREPQ16612 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NREPQ16612 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NREPQ16612 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NREPQ16612 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NREPQ16612 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NREPQ16612 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NREPQ16612 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NREPQ16612 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NREPQ16612 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NREPQ16612 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NREPQ16612 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NREPQ16612 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NREPQ16612 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NREPQ16612 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NREPQ16612 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NREPQ16612 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NREPQ16612 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NREPQ16612 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NREPQ16612 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NREPQ16612 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NREPQ16612 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NREPQ16612 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NREPQ16612 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NREPQ16612 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NREPQ16612 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NREPQ16612 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NREPQ16612 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NREPQ16612 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NREPQ16612 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NREPQ16612 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NREPQ16612 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NREPQ16612 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NREPQ16612 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NREPQ16612 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NREPQ16612 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NREPQ16612 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NREPQ16612 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NREPQ16612 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NREPQ16612 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NREPQ16612 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NREPQ16612 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NREPQ16612 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NREPQ16612 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NREPQ16612 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NREPQ16612 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NREPQ16612 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NREPQ16612 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms