Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

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Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PMCHL1Q16048 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PMCHL1Q16048 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMCHL1Q16048 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMCHL1Q16048 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMCHL1Q16048 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMCHL1Q16048 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PMCHL1Q16048 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PMCHL1Q16048 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PMCHL1Q16048 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PMCHL1Q16048 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PMCHL1Q16048 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PMCHL1Q16048 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PMCHL1Q16048 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PMCHL1Q16048 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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