Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 ESS1YJR017C 513 nt9.78□□□□□ -0.84
CTF3Q12748 SSN3YPL042C 1668 nt9.77□□□□□ -0.84
CTF3Q12748 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.76□□□□□ -0.85
CTF3Q12748 LSB5YCL034W 1065 nt9.76□□□□□ -0.85
CTF3Q12748 UFO1YML088W 2007 nt9.75□□□□□ -0.85
CTF3Q12748 BNI5YNL166C 1347 nt9.73□□□□□ -0.85
CTF3Q12748 CCT5YJR064W 1689 nt9.73□□□□□ -0.85
CTF3Q12748 YJL118WYJL118W 660 nt9.72□□□□□ -0.85
CTF3Q12748 NUC1YJL208C 990 nt9.71□□□□□ -0.86
CTF3Q12748 PHO23YNL097C 993 nt9.7□□□□□ -0.86
CTF3Q12748 RPT5YOR117W 1305 nt9.7□□□□□ -0.86
CTF3Q12748 SAM3YPL274W 1764 nt9.7□□□□□ -0.86
CTF3Q12748 GAL3YDR009W 1563 nt9.69□□□□□ -0.86
CTF3Q12748 FRE6YLL051C 2139 nt9.69□□□□□ -0.86
CTF3Q12748 MSC1YML128C 1542 nt9.68□□□□□ -0.86
CTF3Q12748 SAM2YDR502C 1155 nt9.68□□□□□ -0.86
CTF3Q12748 URA6YKL024C 615 nt9.68□□□□□ -0.86
CTF3Q12748 OYE3YPL171C 1203 nt9.68□□□□□ -0.86
CTF3Q12748 ZRT3YKL175W 1512 nt9.66□□□□□ -0.86
CTF3Q12748 SEC61YLR378C 1443 nt9.66□□□□□ -0.86
CTF3Q12748 PAU5YFL020C 369 nt9.65□□□□□ -0.86
CTF3Q12748 RIB7YBR153W 735 nt9.65□□□□□ -0.86
CTF3Q12748 PGC1YPL206C 966 nt9.64□□□□□ -0.87
CTF3Q12748 OXA1YER154W 1209 nt9.63□□□□□ -0.87
CTF3Q12748 THI72YOR192C 1800 nt9.62□□□□□ -0.87
CTF3Q12748 SEN2YLR105C 1134 nt9.62□□□□□ -0.87
CTF3Q12748 PET8YNL003C 855 nt9.62□□□□□ -0.87
CTF3Q12748 RAS2YNL098C 969 nt9.61□□□□□ -0.87
CTF3Q12748 FUB1YCR076C 753 nt9.6□□□□□ -0.87
CTF3Q12748 SNZ1YMR096W 894 nt9.6□□□□□ -0.87
CTF3Q12748 TPS1YBR126C 1488 nt9.59□□□□□ -0.87
CTF3Q12748 YER188WYER188W 720 nt9.59□□□□□ -0.87
CTF3Q12748 TAF13YML098W 504 nt9.59□□□□□ -0.87
CTF3Q12748 STP3YLR375W 1032 nt9.58□□□□□ -0.88
CTF3Q12748 YBR232CYBR232C 360 nt9.58□□□□□ -0.88
CTF3Q12748 PBP1YGR178C 2169 nt9.57□□□□□ -0.88
CTF3Q12748 OYE2YHR179W 1203 nt9.57□□□□□ -0.88
CTF3Q12748 FLR1YBR008C 1647 nt9.56□□□□□ -0.88
CTF3Q12748 DLD2YDL178W 1593 nt9.56□□□□□ -0.88
CTF3Q12748 YJL067WYJL067W 351 nt9.56□□□□□ -0.88
CTF3Q12748 NAR1YNL240C 1476 nt9.54□□□□□ -0.88
CTF3Q12748 NAP1YKR048C 1254 nt9.54□□□□□ -0.88
CTF3Q12748 EAF3YPR023C 1206 nt9.54□□□□□ -0.88
CTF3Q12748 YMR262WYMR262W 942 nt9.52□□□□□ -0.89
CTF3Q12748 PUP1YOR157C 786 nt9.52□□□□□ -0.89
CTF3Q12748 YPR126CYPR126C 309 nt9.51□□□□□ -0.89
CTF3Q12748 RSC8YFR037C 1674 nt9.51□□□□□ -0.89
CTF3Q12748 YPS3YLR121C 1527 nt9.51□□□□□ -0.89
CTF3Q12748 FMS1YMR020W 1527 nt9.51□□□□□ -0.89
CTF3Q12748 YJL064WYJL064W 396 nt9.49□□□□□ -0.89
CTF3Q12748 MHF1YOL086W-A 273 nt9.49□□□□□ -0.89
CTF3Q12748 CTI6YPL181W 1521 nt9.49□□□□□ -0.89
CTF3Q12748 DAK2YFL053W 1776 nt9.49□□□□□ -0.89
CTF3Q12748 POT1YIL160C 1254 nt9.48□□□□□ -0.89
CTF3Q12748 OSH7YHR001W 1314 nt9.48□□□□□ -0.89
CTF3Q12748 CYT2YKL087C 675 nt9.47□□□□□ -0.89
CTF3Q12748 TMA23YMR269W 636 nt9.46□□□□□ -0.9
CTF3Q12748 SPP2YOR148C 558 nt9.46□□□□□ -0.9
CTF3Q12748 IML3YBR107C 738 nt9.46□□□□□ -0.9
CTF3Q12748 DDI1YER143W 1287 nt9.45□□□□□ -0.9
CTF3Q12748 SOL2YCR073W-A 948 nt9.44□□□□□ -0.9
CTF3Q12748 HEM13YDR044W 987 nt9.44□□□□□ -0.9
CTF3Q12748 CWC15YDR163W 528 nt9.44□□□□□ -0.9
CTF3Q12748 LSM5YER146W 282 nt9.44□□□□□ -0.9
CTF3Q12748 YNL024CYNL024C 741 nt9.43□□□□□ -0.9
CTF3Q12748 GSF2YML048W 1212 nt9.42□□□□□ -0.9
CTF3Q12748 PAU19YMR325W 375 nt9.42□□□□□ -0.9
CTF3Q12748 APS2YJR058C 444 nt9.4□□□□□ -0.9
CTF3Q12748 TAT2YOL020W 1779 nt9.4□□□□□ -0.91
CTF3Q12748 TUB4YLR212C 1422 nt9.39□□□□□ -0.91
CTF3Q12748 ACH1YBL015W 1581 nt9.39□□□□□ -0.91
CTF3Q12748 PAR32YDL173W 888 nt9.39□□□□□ -0.91
CTF3Q12748 IMO32YGR031W 1029 nt9.39□□□□□ -0.91
CTF3Q12748 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.37□□□□□ -0.91
CTF3Q12748 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.37□□□□□ -0.91
CTF3Q12748 YDR455CYDR455C 309 nt9.36□□□□□ -0.91
CTF3Q12748 NIF3YGL221C 867 nt9.36□□□□□ -0.91
CTF3Q12748 VPS62YGR141W 1404 nt9.34□□□□□ -0.91
CTF3Q12748 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt9.34□□□□□ -0.91
CTF3Q12748 SLG1YOR008C 1137 nt9.34□□□□□ -0.91
CTF3Q12748 YAT1YAR035W 2064 nt9.33□□□□□ -0.92
CTF3Q12748 SPS100YHR139C 981 nt9.33□□□□□ -0.92
CTF3Q12748 ASP3-1YLR155C 1089 nt9.31□□□□□ -0.92
CTF3Q12748 ASP3-2YLR157C 1089 nt9.31□□□□□ -0.92
CTF3Q12748 ASP3-3YLR158C 1089 nt9.31□□□□□ -0.92
CTF3Q12748 ASP3-4YLR160C 1089 nt9.31□□□□□ -0.92
CTF3Q12748 TIP1YBR067C 633 nt9.31□□□□□ -0.92
CTF3Q12748 RRT8YOL048C 1029 nt9.29□□□□□ -0.92
CTF3Q12748 ERG13YML126C 1476 nt9.28□□□□□ -0.92
CTF3Q12748 INA1YLR413W 2028 nt9.28□□□□□ -0.92
CTF3Q12748 TIM44YIL022W 1296 nt9.28□□□□□ -0.92
CTF3Q12748 ADE8YDR408C 645 nt9.27□□□□□ -0.93
CTF3Q12748 YDL086WYDL086W 822 nt9.26□□□□□ -0.93
CTF3Q12748 IGD1YFR017C 588 nt9.25□□□□□ -0.93
CTF3Q12748 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.24□□□□□ -0.93
CTF3Q12748 RPC82YPR190C 1965 nt9.24□□□□□ -0.93
CTF3Q12748 TVP23YDR084C 600 nt9.22□□□□□ -0.93
CTF3Q12748 ABZ2YMR289W 1125 nt9.22□□□□□ -0.93
CTF3Q12748 KRE1YNL322C 942 nt9.22□□□□□ -0.93
CTF3Q12748 CMP2YML057W 1815 nt9.21□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.3 ms