Protein–RNA interactions for Protein: Q12234

RUD3, GRIP domain-containing protein RUD3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUD3Q12234 FMS1YMR020W 1527 nt9.78□□□□□ -0.84
RUD3Q12234 PSD1YNL169C 1503 nt9.78□□□□□ -0.84
RUD3Q12234 ZTA1YBR046C 1005 nt9.78□□□□□ -0.84
RUD3Q12234 VPS62YGR141W 1404 nt9.77□□□□□ -0.85
RUD3Q12234 FIT3YOR383C 615 nt9.77□□□□□ -0.85
RUD3Q12234 NRT1YOR071C 1797 nt9.77□□□□□ -0.85
RUD3Q12234 YCR087WYCR087W 516 nt9.76□□□□□ -0.85
RUD3Q12234 RSC8YFR037C 1674 nt9.76□□□□□ -0.85
RUD3Q12234 CYT1YOR065W 930 nt9.75□□□□□ -0.85
RUD3Q12234 DMA2YNL116W 1569 nt9.75□□□□□ -0.85
RUD3Q12234 QDR2YIL121W 1629 nt9.74□□□□□ -0.85
RUD3Q12234 YDL086WYDL086W 822 nt9.74□□□□□ -0.85
RUD3Q12234 UTH1YKR042W 1098 nt9.74□□□□□ -0.85
RUD3Q12234 HEM14YER014W 1620 nt9.74□□□□□ -0.85
RUD3Q12234 GAL2YLR081W 1725 nt9.73□□□□□ -0.85
RUD3Q12234 YGL034CYGL034C 366 nt9.73□□□□□ -0.85
RUD3Q12234 YHL008CYHL008C 1884 nt9.72□□□□□ -0.85
RUD3Q12234 YPS3YLR121C 1527 nt9.72□□□□□ -0.85
RUD3Q12234 CLB6YGR109C 1143 nt9.72□□□□□ -0.85
RUD3Q12234 XYL2YLR070C 1071 nt9.72□□□□□ -0.85
RUD3Q12234 DIG1YPL049C 1359 nt9.72□□□□□ -0.85
RUD3Q12234 UGA4YDL210W 1716 nt9.71□□□□□ -0.85
RUD3Q12234 URA8YJR103W 1737 nt9.71□□□□□ -0.85
RUD3Q12234 SAM2YDR502C 1155 nt9.71□□□□□ -0.86
RUD3Q12234 YMR103CYMR103C 363 nt9.71□□□□□ -0.86
RUD3Q12234 MEP3YPR138C 1470 nt9.71□□□□□ -0.86
RUD3Q12234 FLR1YBR008C 1647 nt9.7□□□□□ -0.86
RUD3Q12234 RPL4BYDR012W 1089 nt9.69□□□□□ -0.86
RUD3Q12234 YRF1-2YER190W 5046 nt9.69□□□□□ -0.86
RUD3Q12234 RPL4AYBR031W 1089 nt9.69□□□□□ -0.86
RUD3Q12234 SBA1YKL117W 651 nt9.68□□□□□ -0.86
RUD3Q12234 ODC1YPL134C 933 nt9.68□□□□□ -0.86
RUD3Q12234 OXA1YER154W 1209 nt9.67□□□□□ -0.86
RUD3Q12234 DLD2YDL178W 1593 nt9.66□□□□□ -0.86
RUD3Q12234 SEC61YLR378C 1443 nt9.65□□□□□ -0.86
RUD3Q12234 TOK1YJL093C 2076 nt9.65□□□□□ -0.86
RUD3Q12234 GID8YMR135C 1368 nt9.65□□□□□ -0.86
RUD3Q12234 AIM45YPR004C 1035 nt9.65□□□□□ -0.86
RUD3Q12234 SSL2YIL143C 2532 nt9.64□□□□□ -0.87
RUD3Q12234 YHR218WYHR218W 1812 nt9.63□□□□□ -0.87
RUD3Q12234 RPS14BYJL191W 417 nt9.62□□□□□ -0.87
RUD3Q12234 MRS6YOR370C 1812 nt9.61□□□□□ -0.87
RUD3Q12234 RBG1YAL036C 1110 nt9.6□□□□□ -0.87
RUD3Q12234 YKL133CYKL133C 1392 nt9.6□□□□□ -0.87
RUD3Q12234 HEM13YDR044W 987 nt9.57□□□□□ -0.88
RUD3Q12234 MDM35YKL053C-A 261 nt9.56□□□□□ -0.88
RUD3Q12234 CWP2YKL096W-A 279 nt9.55□□□□□ -0.88
RUD3Q12234 YHR219WYHR219W 1875 nt9.55□□□□□ -0.88
RUD3Q12234 YER188WYER188W 720 nt9.53□□□□□ -0.88
RUD3Q12234 PHO23YNL097C 993 nt9.51□□□□□ -0.89
RUD3Q12234 BNI5YNL166C 1347 nt9.51□□□□□ -0.89
RUD3Q12234 MSC1YML128C 1542 nt9.51□□□□□ -0.89
RUD3Q12234 THI72YOR192C 1800 nt9.49□□□□□ -0.89
RUD3Q12234 FUB1YCR076C 753 nt9.49□□□□□ -0.89
RUD3Q12234 APT2YDR441C 546 nt9.49□□□□□ -0.89
RUD3Q12234 OSH7YHR001W 1314 nt9.49□□□□□ -0.89
RUD3Q12234 HXT10YFL011W 1641 nt9.49□□□□□ -0.89
RUD3Q12234 TSC10YBR265W 963 nt9.48□□□□□ -0.89
RUD3Q12234 AIM1YAL046C 357 nt9.47□□□□□ -0.89
RUD3Q12234 RSC4YKR008W 1878 nt9.47□□□□□ -0.89
RUD3Q12234 DLD3YEL071W 1491 nt9.47□□□□□ -0.89
RUD3Q12234 HXK1YFR053C 1458 nt9.47□□□□□ -0.89
RUD3Q12234 ENT4YLL038C 744 nt9.46□□□□□ -0.9
RUD3Q12234 YLR279WYLR279W 390 nt9.46□□□□□ -0.9
RUD3Q12234 RPD3YNL330C 1302 nt9.46□□□□□ -0.9
RUD3Q12234 YLR046CYLR046C 813 nt9.45□□□□□ -0.9
RUD3Q12234 ALD5YER073W 1563 nt9.45□□□□□ -0.9
RUD3Q12234 TIM44YIL022W 1296 nt9.44□□□□□ -0.9
RUD3Q12234 SDH5YOL071W 489 nt9.44□□□□□ -0.9
RUD3Q12234 GLR1YPL091W 1452 nt9.43□□□□□ -0.9
RUD3Q12234 FCY21YER060W 1587 nt9.42□□□□□ -0.9
RUD3Q12234 PCP1YGR101W 1041 nt9.42□□□□□ -0.9
RUD3Q12234 LSR1LSR1 1175 nt9.42□□□□□ -0.9
RUD3Q12234 TAT2YOL020W 1779 nt9.4□□□□□ -0.9
RUD3Q12234 YMR262WYMR262W 942 nt9.4□□□□□ -0.9
RUD3Q12234 MSB4YOL112W 1479 nt9.39□□□□□ -0.91
RUD3Q12234 AGP3YFL055W 1677 nt9.39□□□□□ -0.91
RUD3Q12234 ASP3-1YLR155C 1089 nt9.37□□□□□ -0.91
RUD3Q12234 ASP3-2YLR157C 1089 nt9.37□□□□□ -0.91
RUD3Q12234 ASP3-3YLR158C 1089 nt9.37□□□□□ -0.91
RUD3Q12234 ASP3-4YLR160C 1089 nt9.37□□□□□ -0.91
RUD3Q12234 GPN2YOR262W 1044 nt9.37□□□□□ -0.91
RUD3Q12234 FRA1YLL029W 2250 nt9.36□□□□□ -0.91
RUD3Q12234 NBA1YOL070C 1506 nt9.36□□□□□ -0.91
RUD3Q12234 SOL2YCR073W-A 948 nt9.36□□□□□ -0.91
RUD3Q12234 NUC1YJL208C 990 nt9.36□□□□□ -0.91
RUD3Q12234 RAS2YNL098C 969 nt9.36□□□□□ -0.91
RUD3Q12234 YOR072WYOR072W 315 nt9.36□□□□□ -0.91
RUD3Q12234 KRR1YCL059C 951 nt9.35□□□□□ -0.91
RUD3Q12234 CSM1YCR086W 573 nt9.35□□□□□ -0.91
RUD3Q12234 VMA11YPL234C 495 nt9.35□□□□□ -0.91
RUD3Q12234 ITR2YOL103W 1830 nt9.34□□□□□ -0.91
RUD3Q12234 YGR012WYGR012W 1182 nt9.34□□□□□ -0.91
RUD3Q12234 YLR111WYLR111W 333 nt9.33□□□□□ -0.92
RUD3Q12234 YMR244WYMR244W 1068 nt9.33□□□□□ -0.92
RUD3Q12234 RIM2YBR192W 1134 nt9.32□□□□□ -0.92
RUD3Q12234 RPC31YNL151C 756 nt9.31□□□□□ -0.92
RUD3Q12234 MCM5YLR274W 2328 nt9.3□□□□□ -0.92
RUD3Q12234 RAD23YEL037C 1197 nt9.3□□□□□ -0.92
RUD3Q12234 YMR226CYMR226C 804 nt9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 81.6 ms