Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT4

Zgrf1, Protein ZGRF1, mousemouse

Predictions only

Length 1,863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zgrf1Q0VGT4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zgrf1Q0VGT4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zgrf1Q0VGT4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zgrf1Q0VGT4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zgrf1Q0VGT4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zgrf1Q0VGT4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zgrf1Q0VGT4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zgrf1Q0VGT4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zgrf1Q0VGT4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zgrf1Q0VGT4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Zgrf1Q0VGT4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Zgrf1Q0VGT4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zgrf1Q0VGT4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zgrf1Q0VGT4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zgrf1Q0VGT4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zgrf1Q0VGT4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zgrf1Q0VGT4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zgrf1Q0VGT4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zgrf1Q0VGT4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zgrf1Q0VGT4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zgrf1Q0VGT4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zgrf1Q0VGT4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Zgrf1Q0VGT4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zgrf1Q0VGT4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zgrf1Q0VGT4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zgrf1Q0VGT4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zgrf1Q0VGT4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zgrf1Q0VGT4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zgrf1Q0VGT4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zgrf1Q0VGT4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zgrf1Q0VGT4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Zgrf1Q0VGT4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Zgrf1Q0VGT4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zgrf1Q0VGT4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zgrf1Q0VGT4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zgrf1Q0VGT4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zgrf1Q0VGT4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zgrf1Q0VGT4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Zgrf1Q0VGT4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zgrf1Q0VGT4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Zgrf1Q0VGT4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zgrf1Q0VGT4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zgrf1Q0VGT4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zgrf1Q0VGT4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zgrf1Q0VGT4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zgrf1Q0VGT4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zgrf1Q0VGT4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zgrf1Q0VGT4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zgrf1Q0VGT4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Zgrf1Q0VGT4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Zgrf1Q0VGT4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Zgrf1Q0VGT4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zgrf1Q0VGT4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Zgrf1Q0VGT4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zgrf1Q0VGT4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zgrf1Q0VGT4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zgrf1Q0VGT4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zgrf1Q0VGT4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zgrf1Q0VGT4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Zgrf1Q0VGT4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zgrf1Q0VGT4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zgrf1Q0VGT4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zgrf1Q0VGT4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zgrf1Q0VGT4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zgrf1Q0VGT4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zgrf1Q0VGT4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zgrf1Q0VGT4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zgrf1Q0VGT4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zgrf1Q0VGT4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zgrf1Q0VGT4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zgrf1Q0VGT4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zgrf1Q0VGT4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zgrf1Q0VGT4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zgrf1Q0VGT4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Zgrf1Q0VGT4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zgrf1Q0VGT4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zgrf1Q0VGT4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zgrf1Q0VGT4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zgrf1Q0VGT4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zgrf1Q0VGT4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zgrf1Q0VGT4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zgrf1Q0VGT4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zgrf1Q0VGT4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zgrf1Q0VGT4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zgrf1Q0VGT4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zgrf1Q0VGT4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zgrf1Q0VGT4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zgrf1Q0VGT4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zgrf1Q0VGT4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zgrf1Q0VGT4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zgrf1Q0VGT4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zgrf1Q0VGT4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zgrf1Q0VGT4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zgrf1Q0VGT4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zgrf1Q0VGT4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zgrf1Q0VGT4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zgrf1Q0VGT4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zgrf1Q0VGT4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zgrf1Q0VGT4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zgrf1Q0VGT4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms