Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 YPL251WYPL251W 303 nt7.83□□□□□ -1.16
HRD1Q08109 UFO1YML088W 2007 nt7.83□□□□□ -1.16
HRD1Q08109 GND2YGR256W 1479 nt7.82□□□□□ -1.16
HRD1Q08109 SAM2YDR502C 1155 nt7.82□□□□□ -1.16
HRD1Q08109 TRT2tT(CGU)K 72 nt7.82□□□□□ -1.16
HRD1Q08109 MEP3YPR138C 1470 nt7.81□□□□□ -1.16
HRD1Q08109 ILV3YJR016C 1758 nt7.81□□□□□ -1.16
HRD1Q08109 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt7.8□□□□□ -1.16
HRD1Q08109 YNL024CYNL024C 741 nt7.8□□□□□ -1.16
HRD1Q08109 YMR103CYMR103C 363 nt7.79□□□□□ -1.16
HRD1Q08109 ALD5YER073W 1563 nt7.77□□□□□ -1.17
HRD1Q08109 YGR012WYGR012W 1182 nt7.77□□□□□ -1.17
HRD1Q08109 SBA1YKL117W 651 nt7.77□□□□□ -1.17
HRD1Q08109 YLR279WYLR279W 390 nt7.77□□□□□ -1.17
HRD1Q08109 YOR325WYOR325W 474 nt7.75□□□□□ -1.17
HRD1Q08109 SEC61YLR378C 1443 nt7.75□□□□□ -1.17
HRD1Q08109 VPS62YGR141W 1404 nt7.73□□□□□ -1.17
HRD1Q08109 APT2YDR441C 546 nt7.73□□□□□ -1.17
HRD1Q08109 OPI10YOL032W 741 nt7.73□□□□□ -1.17
HRD1Q08109 SPP2YOR148C 558 nt7.73□□□□□ -1.17
HRD1Q08109 HOL1YNR055C 1761 nt7.72□□□□□ -1.17
HRD1Q08109 CCT2YIL142W 1584 nt7.71□□□□□ -1.17
HRD1Q08109 RSC8YFR037C 1674 nt7.71□□□□□ -1.18
HRD1Q08109 MSB4YOL112W 1479 nt7.71□□□□□ -1.18
HRD1Q08109 RAD23YEL037C 1197 nt7.71□□□□□ -1.18
HRD1Q08109 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt7.71□□□□□ -1.18
HRD1Q08109 MTO1YGL236C 2010 nt7.7□□□□□ -1.18
HRD1Q08109 OXA1YER154W 1209 nt7.7□□□□□ -1.18
HRD1Q08109 YLR111WYLR111W 333 nt7.7□□□□□ -1.18
HRD1Q08109 FMS1YMR020W 1527 nt7.69□□□□□ -1.18
HRD1Q08109 YDL086WYDL086W 822 nt7.68□□□□□ -1.18
HRD1Q08109 YMR209CYMR209C 1374 nt7.68□□□□□ -1.18
HRD1Q08109 FRA1YLL029W 2250 nt7.67□□□□□ -1.18
HRD1Q08109 RSC4YKR008W 1878 nt7.67□□□□□ -1.18
HRD1Q08109 HIS2YFR025C 1008 nt7.67□□□□□ -1.18
HRD1Q08109 GLR1YPL091W 1452 nt7.67□□□□□ -1.18
HRD1Q08109 YPS3YLR121C 1527 nt7.67□□□□□ -1.18
HRD1Q08109 FCY21YER060W 1587 nt7.67□□□□□ -1.18
HRD1Q08109 COQ8YGL119W 1506 nt7.66□□□□□ -1.18
HRD1Q08109 DLD2YDL178W 1593 nt7.66□□□□□ -1.18
HRD1Q08109 TPN1YGL186C 1740 nt7.66□□□□□ -1.18
HRD1Q08109 TOM71YHR117W 1920 nt7.64□□□□□ -1.19
HRD1Q08109 FLR1YBR008C 1647 nt7.64□□□□□ -1.19
HRD1Q08109 GND1YHR183W 1470 nt7.64□□□□□ -1.19
HRD1Q08109 YER188WYER188W 720 nt7.64□□□□□ -1.19
HRD1Q08109 NUC1YJL208C 990 nt7.64□□□□□ -1.19
HRD1Q08109 ACH1YBL015W 1581 nt7.63□□□□□ -1.19
HRD1Q08109 ARO8YGL202W 1503 nt7.63□□□□□ -1.19
HRD1Q08109 BNI5YNL166C 1347 nt7.63□□□□□ -1.19
HRD1Q08109 PHO23YNL097C 993 nt7.63□□□□□ -1.19
HRD1Q08109 BET2YPR176C 978 nt7.63□□□□□ -1.19
HRD1Q08109 RIB3YDR487C 627 nt7.62□□□□□ -1.19
HRD1Q08109 NSG2YNL156C 900 nt7.62□□□□□ -1.19
HRD1Q08109 MSC1YML128C 1542 nt7.62□□□□□ -1.19
HRD1Q08109 KES1YPL145C 1305 nt7.61□□□□□ -1.19
HRD1Q08109 YMR226CYMR226C 804 nt7.61□□□□□ -1.19
HRD1Q08109 OSH7YHR001W 1314 nt7.6□□□□□ -1.19
HRD1Q08109 ALR1YOL130W 2580 nt7.6□□□□□ -1.19
HRD1Q08109 LSB5YCL034W 1065 nt7.6□□□□□ -1.19
HRD1Q08109 QDR2YIL121W 1629 nt7.6□□□□□ -1.19
HRD1Q08109 DIG1YPL049C 1359 nt7.59□□□□□ -1.19
HRD1Q08109 RAS2YNL098C 969 nt7.59□□□□□ -1.19
HRD1Q08109 SMM1YNR015W 1155 nt7.59□□□□□ -1.19
HRD1Q08109 FUB1YCR076C 753 nt7.58□□□□□ -1.2
HRD1Q08109 PRY1YJL079C 900 nt7.58□□□□□ -1.2
HRD1Q08109 PSD1YNL169C 1503 nt7.57□□□□□ -1.2
HRD1Q08109 SGA1YIL099W 1650 nt7.57□□□□□ -1.2
HRD1Q08109 LSB6YJL100W 1824 nt7.57□□□□□ -1.2
HRD1Q08109 CSM1YCR086W 573 nt7.55□□□□□ -1.2
HRD1Q08109 UGP1YKL035W 1500 nt7.54□□□□□ -1.2
HRD1Q08109 HEM13YDR044W 987 nt7.54□□□□□ -1.2
HRD1Q08109 LOT5YKL183W 921 nt7.54□□□□□ -1.2
HRD1Q08109 CYT1YOR065W 930 nt7.54□□□□□ -1.2
HRD1Q08109 YOR072WYOR072W 315 nt7.53□□□□□ -1.2
HRD1Q08109 SFL1YOR140W 2301 nt7.53□□□□□ -1.2
HRD1Q08109 RPT5YOR117W 1305 nt7.52□□□□□ -1.2
HRD1Q08109 YRF1-2YER190W 5046 nt7.51□□□□□ -1.21
HRD1Q08109 YMR244WYMR244W 1068 nt7.51□□□□□ -1.21
HRD1Q08109 LSB3YFR024C-A 1380 nt7.5□□□□□ -1.21
HRD1Q08109 SOL2YCR073W-A 948 nt7.5□□□□□ -1.21
HRD1Q08109 ENT4YLL038C 744 nt7.5□□□□□ -1.21
HRD1Q08109 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt7.5□□□□□ -1.21
HRD1Q08109 GID8YMR135C 1368 nt7.49□□□□□ -1.21
HRD1Q08109 ASP3-1YLR155C 1089 nt7.49□□□□□ -1.21
HRD1Q08109 ASP3-2YLR157C 1089 nt7.49□□□□□ -1.21
HRD1Q08109 ASP3-3YLR158C 1089 nt7.49□□□□□ -1.21
HRD1Q08109 ASP3-4YLR160C 1089 nt7.49□□□□□ -1.21
HRD1Q08109 GPN2YOR262W 1044 nt7.49□□□□□ -1.21
HRD1Q08109 VRG4YGL225W 1014 nt7.48□□□□□ -1.21
HRD1Q08109 OYE2YHR179W 1203 nt7.48□□□□□ -1.21
HRD1Q08109 AIM1YAL046C 357 nt7.48□□□□□ -1.21
HRD1Q08109 CAB5YDR196C 726 nt7.47□□□□□ -1.21
HRD1Q08109 PCP1YGR101W 1041 nt7.47□□□□□ -1.21
HRD1Q08109 YLR046CYLR046C 813 nt7.47□□□□□ -1.21
HRD1Q08109 MDL2YPL270W 2322 nt7.47□□□□□ -1.21
HRD1Q08109 YJL118WYJL118W 660 nt7.46□□□□□ -1.22
HRD1Q08109 RIB7YBR153W 735 nt7.46□□□□□ -1.22
HRD1Q08109 YLR173WYLR173W 1827 nt7.45□□□□□ -1.22
HRD1Q08109 YKL133CYKL133C 1392 nt7.45□□□□□ -1.22
HRD1Q08109 RTG2YGL252C 1767 nt7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.6 ms