Protein–RNA interactions for Protein: Q01454

CTF4, DNA polymerase alpha-binding protein, yeastyeast

Predictions only

Length 927 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF4Q01454 SAM2YDR502C 1155 nt11.65□□□□□ -0.54
CTF4Q01454 NAP1YKR048C 1254 nt11.65□□□□□ -0.54
CTF4Q01454 RPT5YOR117W 1305 nt11.63□□□□□ -0.55
CTF4Q01454 YJL118WYJL118W 660 nt11.62□□□□□ -0.55
CTF4Q01454 TAF13YML098W 504 nt11.62□□□□□ -0.55
CTF4Q01454 THI72YOR192C 1800 nt11.62□□□□□ -0.55
CTF4Q01454 TRT2tT(CGU)K 72 nt11.61□□□□□ -0.55
CTF4Q01454 PGC1YPL206C 966 nt11.61□□□□□ -0.55
CTF4Q01454 RIB7YBR153W 735 nt11.61□□□□□ -0.55
CTF4Q01454 BNI5YNL166C 1347 nt11.6□□□□□ -0.55
CTF4Q01454 SHY1YGR112W 1170 nt11.59□□□□□ -0.55
CTF4Q01454 STP3YLR375W 1032 nt11.59□□□□□ -0.55
CTF4Q01454 GAL3YDR009W 1563 nt11.57□□□□□ -0.56
CTF4Q01454 SEC61YLR378C 1443 nt11.54□□□□□ -0.56
CTF4Q01454 PHO23YNL097C 993 nt11.54□□□□□ -0.56
CTF4Q01454 RAS2YNL098C 969 nt11.54□□□□□ -0.56
CTF4Q01454 PUP1YOR157C 786 nt11.54□□□□□ -0.56
CTF4Q01454 YBR232CYBR232C 360 nt11.54□□□□□ -0.56
CTF4Q01454 OYE3YPL171C 1203 nt11.51□□□□□ -0.57
CTF4Q01454 MSC1YML128C 1542 nt11.5□□□□□ -0.57
CTF4Q01454 YJL064WYJL064W 396 nt11.5□□□□□ -0.57
CTF4Q01454 UFO1YML088W 2007 nt11.5□□□□□ -0.57
CTF4Q01454 URA6YKL024C 615 nt11.49□□□□□ -0.57
CTF4Q01454 TPS1YBR126C 1488 nt11.49□□□□□ -0.57
CTF4Q01454 SAM3YPL274W 1764 nt11.49□□□□□ -0.57
CTF4Q01454 YMR262WYMR262W 942 nt11.48□□□□□ -0.57
CTF4Q01454 PET8YNL003C 855 nt11.48□□□□□ -0.57
CTF4Q01454 BIO5YNR056C 1686 nt11.47□□□□□ -0.57
CTF4Q01454 OYE2YHR179W 1203 nt11.46□□□□□ -0.57
CTF4Q01454 YER188WYER188W 720 nt11.45□□□□□ -0.58
CTF4Q01454 SNZ1YMR096W 894 nt11.45□□□□□ -0.58
CTF4Q01454 ZRT3YKL175W 1512 nt11.45□□□□□ -0.58
CTF4Q01454 OXA1YER154W 1209 nt11.43□□□□□ -0.58
CTF4Q01454 FUB1YCR076C 753 nt11.42□□□□□ -0.58
CTF4Q01454 POT1YIL160C 1254 nt11.41□□□□□ -0.58
CTF4Q01454 PAU19YMR325W 375 nt11.41□□□□□ -0.58
CTF4Q01454 MHF1YOL086W-A 273 nt11.39□□□□□ -0.59
CTF4Q01454 CTI6YPL181W 1521 nt11.38□□□□□ -0.59
CTF4Q01454 UME6YDR207C 2511 nt11.38□□□□□ -0.59
CTF4Q01454 IML3YBR107C 738 nt11.37□□□□□ -0.59
CTF4Q01454 GSF2YML048W 1212 nt11.36□□□□□ -0.59
CTF4Q01454 YNL024CYNL024C 741 nt11.36□□□□□ -0.59
CTF4Q01454 EAF3YPR023C 1206 nt11.36□□□□□ -0.59
CTF4Q01454 DLD2YDL178W 1593 nt11.36□□□□□ -0.59
CTF4Q01454 PAR32YDL173W 888 nt11.35□□□□□ -0.59
CTF4Q01454 YPR126CYPR126C 309 nt11.35□□□□□ -0.59
CTF4Q01454 OSH7YHR001W 1314 nt11.35□□□□□ -0.59
CTF4Q01454 LSM5YER146W 282 nt11.34□□□□□ -0.59
CTF4Q01454 SLG1YOR008C 1137 nt11.34□□□□□ -0.59
CTF4Q01454 TUB4YLR212C 1422 nt11.34□□□□□ -0.59
CTF4Q01454 DAK2YFL053W 1776 nt11.33□□□□□ -0.6
CTF4Q01454 TIP1YBR067C 633 nt11.32□□□□□ -0.6
CTF4Q01454 FLR1YBR008C 1647 nt11.31□□□□□ -0.6
CTF4Q01454 TIM44YIL022W 1296 nt11.31□□□□□ -0.6
CTF4Q01454 RSC8YFR037C 1674 nt11.3□□□□□ -0.6
CTF4Q01454 DDI1YER143W 1287 nt11.3□□□□□ -0.6
CTF4Q01454 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.28□□□□□ -0.6
CTF4Q01454 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.28□□□□□ -0.6
CTF4Q01454 TMA23YMR269W 636 nt11.28□□□□□ -0.6
CTF4Q01454 ALG12YNR030W 1656 nt11.27□□□□□ -0.6
CTF4Q01454 SOL2YCR073W-A 948 nt11.27□□□□□ -0.61
CTF4Q01454 YJL067WYJL067W 351 nt11.27□□□□□ -0.61
CTF4Q01454 APS2YJR058C 444 nt11.27□□□□□ -0.61
CTF4Q01454 CWC15YDR163W 528 nt11.26□□□□□ -0.61
CTF4Q01454 SPP2YOR148C 558 nt11.26□□□□□ -0.61
CTF4Q01454 YPS3YLR121C 1527 nt11.25□□□□□ -0.61
CTF4Q01454 FMS1YMR020W 1527 nt11.25□□□□□ -0.61
CTF4Q01454 FRE6YLL051C 2139 nt11.22□□□□□ -0.61
CTF4Q01454 KRE1YNL322C 942 nt11.22□□□□□ -0.61
CTF4Q01454 IMO32YGR031W 1029 nt11.2□□□□□ -0.62
CTF4Q01454 NIF3YGL221C 867 nt11.19□□□□□ -0.62
CTF4Q01454 SPS100YHR139C 981 nt11.17□□□□□ -0.62
CTF4Q01454 HEM13YDR044W 987 nt11.16□□□□□ -0.62
CTF4Q01454 IGD1YFR017C 588 nt11.15□□□□□ -0.62
CTF4Q01454 VPS62YGR141W 1404 nt11.15□□□□□ -0.62
CTF4Q01454 RIB1YBL033C 1038 nt11.13□□□□□ -0.63
CTF4Q01454 ADE8YDR408C 645 nt11.12□□□□□ -0.63
CTF4Q01454 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt11.12□□□□□ -0.63
CTF4Q01454 ASP3-1YLR155C 1089 nt11.12□□□□□ -0.63
CTF4Q01454 ASP3-2YLR157C 1089 nt11.12□□□□□ -0.63
CTF4Q01454 ASP3-3YLR158C 1089 nt11.12□□□□□ -0.63
CTF4Q01454 ASP3-4YLR160C 1089 nt11.12□□□□□ -0.63
CTF4Q01454 TAT2YOL020W 1779 nt11.11□□□□□ -0.63
CTF4Q01454 SOD2YHR008C 702 nt11.11□□□□□ -0.63
CTF4Q01454 YDR455CYDR455C 309 nt11.1□□□□□ -0.63
CTF4Q01454 YCR025CYCR025C 411 nt11.08□□□□□ -0.64
CTF4Q01454 YIA6YIL006W 1122 nt11.08□□□□□ -0.64
CTF4Q01454 YJR114WYJR114W 393 nt11.08□□□□□ -0.64
CTF4Q01454 PBP1YGR178C 2169 nt11.08□□□□□ -0.64
CTF4Q01454 ACO2YJL200C 2370 nt11.08□□□□□ -0.64
CTF4Q01454 ERG6YML008C 1152 nt11.07□□□□□ -0.64
CTF4Q01454 NAR1YNL240C 1476 nt11.06□□□□□ -0.64
CTF4Q01454 ABZ2YMR289W 1125 nt11.06□□□□□ -0.64
CTF4Q01454 SPE2YOL052C 1191 nt11.06□□□□□ -0.64
CTF4Q01454 ERG13YML126C 1476 nt11.06□□□□□ -0.64
CTF4Q01454 CYT2YKL087C 675 nt11.05□□□□□ -0.64
CTF4Q01454 YDL086WYDL086W 822 nt11.04□□□□□ -0.64
CTF4Q01454 ACH1YBL015W 1581 nt11.03□□□□□ -0.64
CTF4Q01454 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt11.03□□□□□ -0.64
CTF4Q01454 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt11.03□□□□□ -0.64
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