Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gja5Q01231 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gja5Q01231 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gja5Q01231 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gja5Q01231 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gja5Q01231 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gja5Q01231 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gja5Q01231 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gja5Q01231 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Gja5Q01231 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gja5Q01231 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gja5Q01231 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Gja5Q01231 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Gja5Q01231 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Gja5Q01231 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Gja5Q01231 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Gja5Q01231 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Gja5Q01231 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Gja5Q01231 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gja5Q01231 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Gja5Q01231 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Gja5Q01231 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Gja5Q01231 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Gja5Q01231 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Gja5Q01231 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Gja5Q01231 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Gja5Q01231 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Gja5Q01231 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Gja5Q01231 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Gja5Q01231 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Gja5Q01231 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Gja5Q01231 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Gja5Q01231 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Gja5Q01231 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Gja5Q01231 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Gja5Q01231 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gja5Q01231 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Gja5Q01231 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Gja5Q01231 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Gja5Q01231 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Gja5Q01231 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Gja5Q01231 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Gja5Q01231 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Gja5Q01231 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Gja5Q01231 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Gja5Q01231 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Gja5Q01231 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Gja5Q01231 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Gja5Q01231 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Gja5Q01231 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Gja5Q01231 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Gja5Q01231 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Gja5Q01231 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Gja5Q01231 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Gja5Q01231 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Gja5Q01231 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Gja5Q01231 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Gja5Q01231 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gja5Q01231 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Gja5Q01231 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Gja5Q01231 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Gja5Q01231 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Gja5Q01231 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Gja5Q01231 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Gja5Q01231 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Gja5Q01231 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Gja5Q01231 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Gja5Q01231 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Gja5Q01231 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Gja5Q01231 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Gja5Q01231 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Gja5Q01231 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Gja5Q01231 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Gja5Q01231 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Gja5Q01231 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Gja5Q01231 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Gja5Q01231 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gja5Q01231 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gja5Q01231 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Gja5Q01231 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gja5Q01231 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gja5Q01231 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Gja5Q01231 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Gja5Q01231 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Gja5Q01231 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gja5Q01231 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gja5Q01231 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gja5Q01231 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gja5Q01231 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Gja5Q01231 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Gja5Q01231 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Gja5Q01231 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Gja5Q01231 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Gja5Q01231 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Gja5Q01231 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Gja5Q01231 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Gja5Q01231 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gja5Q01231 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gja5Q01231 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gja5Q01231 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms