Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp9bP98195 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp9bP98195 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp9bP98195 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp9bP98195 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp9bP98195 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp9bP98195 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp9bP98195 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp9bP98195 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atp9bP98195 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atp9bP98195 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atp9bP98195 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp9bP98195 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp9bP98195 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp9bP98195 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp9bP98195 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp9bP98195 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp9bP98195 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp9bP98195 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp9bP98195 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp9bP98195 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp9bP98195 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atp9bP98195 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atp9bP98195 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp9bP98195 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp9bP98195 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp9bP98195 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp9bP98195 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp9bP98195 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp9bP98195 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp9bP98195 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp9bP98195 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp9bP98195 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp9bP98195 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp9bP98195 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp9bP98195 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atp9bP98195 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp9bP98195 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp9bP98195 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp9bP98195 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp9bP98195 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp9bP98195 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp9bP98195 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp9bP98195 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp9bP98195 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp9bP98195 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp9bP98195 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp9bP98195 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp9bP98195 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp9bP98195 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp9bP98195 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp9bP98195 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp9bP98195 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp9bP98195 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp9bP98195 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp9bP98195 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp9bP98195 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp9bP98195 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp9bP98195 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp9bP98195 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp9bP98195 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp9bP98195 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp9bP98195 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp9bP98195 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atp9bP98195 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp9bP98195 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp9bP98195 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp9bP98195 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp9bP98195 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp9bP98195 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp9bP98195 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp9bP98195 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp9bP98195 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp9bP98195 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp9bP98195 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp9bP98195 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp9bP98195 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp9bP98195 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp9bP98195 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp9bP98195 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp9bP98195 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp9bP98195 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp9bP98195 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp9bP98195 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp9bP98195 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp9bP98195 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp9bP98195 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp9bP98195 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp9bP98195 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp9bP98195 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp9bP98195 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp9bP98195 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp9bP98195 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp9bP98195 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp9bP98195 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp9bP98195 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atp9bP98195 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp9bP98195 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp9bP98195 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp9bP98195 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms