Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
NyxP83503 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
NyxP83503 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
NyxP83503 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
NyxP83503 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2,39
NyxP83503 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2,39
NyxP83503 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
NyxP83503 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29,99■■■□□ 2,39
NyxP83503 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
NyxP83503 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,99■■■□□ 2,39
NyxP83503 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
NyxP83503 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,96■■■□□ 2,39
NyxP83503 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
NyxP83503 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
NyxP83503 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
NyxP83503 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,39
NyxP83503 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,95■■■□□ 2,39
NyxP83503 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
NyxP83503 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
NyxP83503 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
NyxP83503 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
NyxP83503 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
NyxP83503 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
NyxP83503 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
NyxP83503 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
NyxP83503 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
NyxP83503 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
NyxP83503 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
NyxP83503 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
NyxP83503 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
NyxP83503 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
NyxP83503 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
NyxP83503 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
NyxP83503 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
NyxP83503 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
NyxP83503 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29,81■■■□□ 2,36
NyxP83503 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
NyxP83503 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29,81■■■□□ 2,36
NyxP83503 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
NyxP83503 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
NyxP83503 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
NyxP83503 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
NyxP83503 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
NyxP83503 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29,76■■■□□ 2,35
NyxP83503 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29,75■■■□□ 2,35
NyxP83503 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29,75■■■□□ 2,35
NyxP83503 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
NyxP83503 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29,74■■■□□ 2,35
NyxP83503 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
NyxP83503 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29,73■■■□□ 2,35
NyxP83503 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
NyxP83503 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
NyxP83503 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
NyxP83503 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
NyxP83503 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
NyxP83503 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29,65■■■□□ 2,34
NyxP83503 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
NyxP83503 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
NyxP83503 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
NyxP83503 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29,64■■■□□ 2,34
NyxP83503 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
NyxP83503 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
NyxP83503 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
NyxP83503 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29,63■■■□□ 2,33
NyxP83503 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29,62■■■□□ 2,33
NyxP83503 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
NyxP83503 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
NyxP83503 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
NyxP83503 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
NyxP83503 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
NyxP83503 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
NyxP83503 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29,56■■■□□ 2,32
NyxP83503 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
NyxP83503 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
NyxP83503 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
NyxP83503 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29,53■■■□□ 2,32
NyxP83503 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29,53■■■□□ 2,32
NyxP83503 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
NyxP83503 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
NyxP83503 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
NyxP83503 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29,5■■■□□ 2,31
NyxP83503 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
NyxP83503 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
NyxP83503 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
NyxP83503 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
NyxP83503 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
NyxP83503 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
NyxP83503 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29,47■■■□□ 2,31
NyxP83503 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29,47■■■□□ 2,31
NyxP83503 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
NyxP83503 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
NyxP83503 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29,45■■■□□ 2,31
NyxP83503 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29,45■■■□□ 2,31
NyxP83503 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29,45■■■□□ 2,31
NyxP83503 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
NyxP83503 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29,44■■■□□ 2,3
NyxP83503 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,43■■■□□ 2,3
NyxP83503 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
NyxP83503 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
NyxP83503 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms