Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00315P59091 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00315P59091 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00315P59091 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00315P59091 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00315P59091 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00315P59091 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00315P59091 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00315P59091 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00315P59091 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00315P59091 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00315P59091 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00315P59091 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00315P59091 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00315P59091 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00315P59091 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00315P59091 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00315P59091 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00315P59091 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00315P59091 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00315P59091 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00315P59091 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00315P59091 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00315P59091 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00315P59091 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00315P59091 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00315P59091 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00315P59091 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00315P59091 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00315P59091 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00315P59091 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00315P59091 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00315P59091 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00315P59091 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC00315P59091 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC00315P59091 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00315P59091 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00315P59091 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00315P59091 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00315P59091 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00315P59091 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00315P59091 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00315P59091 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00315P59091 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00315P59091 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00315P59091 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00315P59091 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00315P59091 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00315P59091 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00315P59091 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00315P59091 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00315P59091 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00315P59091 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00315P59091 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00315P59091 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms