Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PtpaP58389 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtpaP58389 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtpaP58389 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PtpaP58389 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtpaP58389 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtpaP58389 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtpaP58389 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PtpaP58389 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtpaP58389 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtpaP58389 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtpaP58389 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtpaP58389 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtpaP58389 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtpaP58389 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PtpaP58389 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtpaP58389 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtpaP58389 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtpaP58389 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtpaP58389 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtpaP58389 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtpaP58389 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtpaP58389 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtpaP58389 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtpaP58389 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtpaP58389 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtpaP58389 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtpaP58389 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtpaP58389 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PtpaP58389 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtpaP58389 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtpaP58389 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtpaP58389 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtpaP58389 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtpaP58389 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtpaP58389 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtpaP58389 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtpaP58389 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtpaP58389 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtpaP58389 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtpaP58389 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtpaP58389 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PtpaP58389 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtpaP58389 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtpaP58389 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtpaP58389 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtpaP58389 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtpaP58389 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtpaP58389 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtpaP58389 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtpaP58389 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtpaP58389 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtpaP58389 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtpaP58389 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtpaP58389 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtpaP58389 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtpaP58389 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtpaP58389 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtpaP58389 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtpaP58389 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtpaP58389 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtpaP58389 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PtpaP58389 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtpaP58389 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtpaP58389 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtpaP58389 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtpaP58389 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PtpaP58389 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PtpaP58389 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtpaP58389 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtpaP58389 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtpaP58389 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtpaP58389 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtpaP58389 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtpaP58389 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtpaP58389 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtpaP58389 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtpaP58389 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtpaP58389 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtpaP58389 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtpaP58389 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtpaP58389 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtpaP58389 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtpaP58389 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtpaP58389 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtpaP58389 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtpaP58389 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PtpaP58389 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtpaP58389 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtpaP58389 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtpaP58389 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtpaP58389 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtpaP58389 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtpaP58389 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtpaP58389 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtpaP58389 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtpaP58389 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtpaP58389 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtpaP58389 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtpaP58389 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms