Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RP1P56715 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RP1P56715 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RP1P56715 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RP1P56715 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RP1P56715 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RP1P56715 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RP1P56715 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RP1P56715 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RP1P56715 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RP1P56715 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RP1P56715 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RP1P56715 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RP1P56715 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RP1P56715 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RP1P56715 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RP1P56715 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RP1P56715 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RP1P56715 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RP1P56715 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RP1P56715 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RP1P56715 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RP1P56715 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RP1P56715 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RP1P56715 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RP1P56715 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RP1P56715 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RP1P56715 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RP1P56715 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RP1P56715 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RP1P56715 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RP1P56715 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RP1P56715 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RP1P56715 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RP1P56715 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RP1P56715 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RP1P56715 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RP1P56715 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RP1P56715 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RP1P56715 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RP1P56715 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RP1P56715 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RP1P56715 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RP1P56715 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RP1P56715 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RP1P56715 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RP1P56715 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RP1P56715 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RP1P56715 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RP1P56715 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RP1P56715 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RP1P56715 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RP1P56715 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RP1P56715 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RP1P56715 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RP1P56715 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RP1P56715 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RP1P56715 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RP1P56715 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RP1P56715 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RP1P56715 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RP1P56715 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RP1P56715 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RP1P56715 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RP1P56715 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RP1P56715 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RP1P56715 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RP1P56715 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RP1P56715 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RP1P56715 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RP1P56715 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RP1P56715 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RP1P56715 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RP1P56715 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RP1P56715 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RP1P56715 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RP1P56715 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RP1P56715 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RP1P56715 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RP1P56715 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RP1P56715 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RP1P56715 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RP1P56715 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RP1P56715 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RP1P56715 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RP1P56715 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RP1P56715 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RP1P56715 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RP1P56715 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RP1P56715 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RP1P56715 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RP1P56715 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RP1P56715 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RP1P56715 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RP1P56715 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RP1P56715 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RP1P56715 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RP1P56715 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RP1P56715 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RP1P56715 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms