Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.437e-8■■■■■ 43.9
HNRNPMP52272 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.843e-13■■■■■ 43.9
HNRNPMP52272 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.743e-13■■■■■ 43.9
HNRNPMP52272 COMMD10-204ENST00000507356 870 ntTSL 319.03■□□□□ 0.643e-13■■■■■ 43.9
HNRNPMP52272 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.593e-13■■■■■ 43.9
HNRNPMP52272 COMMD10-203ENST00000506589 793 ntTSL 53.9□□□□□ -1.793e-13■■■■■ 43.9
HNRNPMP52272 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 43.8
HNRNPMP52272 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 43.8
HNRNPMP52272 CDCA2-205ENST00000523454 922 ntTSL 56.7□□□□□ -1.341e-6■■■■■ 43.8
HNRNPMP52272 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.38e-15■■■■■ 43.8
HNRNPMP52272 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.678e-15■■■■■ 43.8
HNRNPMP52272 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.268e-15■■■■■ 43.8
HNRNPMP52272 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.348e-15■■■■■ 43.8
HNRNPMP52272 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.318e-15■■■■■ 43.8
HNRNPMP52272 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.514e-9■■■■■ 43.7
HNRNPMP52272 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.224e-9■■■■■ 43.7
HNRNPMP52272 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.014e-9■■■■■ 43.7
HNRNPMP52272 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.974e-9■■■■■ 43.7
HNRNPMP52272 ANKRD13D-207ENST00000506531 1118 ntTSL 527.25■■□□□ 1.954e-9■■■■■ 43.7
HNRNPMP52272 ANKRD13D-203ENST00000504186 564 ntTSL 416.06■□□□□ 0.164e-9■■■■■ 43.7
HNRNPMP52272 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.354e-8■■■■■ 43.6
HNRNPMP52272 WDR4-207ENST00000492742 2205 ntTSL 228.26■■■□□ 2.114e-8■■■■■ 43.6
HNRNPMP52272 WDR4-205ENST00000476326 1977 ntTSL 1 (best)20.83■□□□□ 0.924e-8■■■■■ 43.6
HNRNPMP52272 CHD4-202ENST00000430771 527 ntTSL 416.76■□□□□ 0.273e-8■■■■■ 43.4
HNRNPMP52272 ACVR2A-203ENST00000462659 746 ntTSL 325.46■■□□□ 1.672e-7■■■■■ 43.3
HNRNPMP52272 ACVR2A-205ENST00000487959 274 ntTSL 421.96■■□□□ 1.112e-7■■■■■ 43.3
HNRNPMP52272 ACVR2A-202ENST00000404590 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.412e-7■■■■■ 43.3
HNRNPMP52272 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 43.3
HNRNPMP52272 ACVR2A-207ENST00000535787 5166 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 43.3
HNRNPMP52272 ACVR2A-204ENST00000465329 993 ntTSL 28.64□□□□□ -1.032e-7■■■■■ 43.3
HNRNPMP52272 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.823e-6■■■■■ 43.2
HNRNPMP52272 SPRED2-207ENST00000452315 1365 ntTSL 1 (best)26.28■■□□□ 1.87e-13■■■■■ 43.2
HNRNPMP52272 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.717e-13■■■■■ 43.2
HNRNPMP52272 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.173e-6■■■■■ 43.2
HNRNPMP52272 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 43.2
HNRNPMP52272 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.43e-6■■■■■ 43.2
HNRNPMP52272 SPRED2-208ENST00000474228 876 ntTSL 316.55■□□□□ 0.247e-13■■■■■ 43.2
HNRNPMP52272 PCMTD1-203ENST00000519559 1204 ntTSL 211.02□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 43.2
HNRNPMP52272 ATP1A1-204ENST00000418797 654 ntTSL 332.16■■■□□ 2.745e-10■■■■■ 43.1
HNRNPMP52272 ATP1A1-208ENST00000488733 1728 ntTSL 229.51■■■□□ 2.315e-10■■■■■ 43.1
HNRNPMP52272 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.455e-10■■■■■ 43.1
HNRNPMP52272 ATP1A1-211ENST00000537345 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.125e-10■■■■■ 43.1
HNRNPMP52272 TAOK1-205ENST00000583121 526 ntTSL 314.6□□□□□ -0.074e-11■■■■■ 43.1
HNRNPMP52272 TAOK1-201ENST00000261716 12407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.494e-11■■■■■ 43.1
HNRNPMP52272 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.894e-11■■■■■ 43.1
HNRNPMP52272 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.244e-11■■■■■ 43.1
HNRNPMP52272 TAOK1-206ENST00000587277 353 ntTSL 24.59□□□□□ -1.674e-11■■■■■ 43.1
HNRNPMP52272 GAPVD1-220ENST00000497580 3720 ntTSL 216.54■□□□□ 0.246e-13■■■■■ 43.1
HNRNPMP52272 GAPVD1-219ENST00000495955 5309 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.256e-13■■■■■ 43.1
HNRNPMP52272 GAPVD1-204ENST00000394083 4747 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.416e-13■■■■■ 43.1
HNRNPMP52272 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.646e-13■■■■■ 43.1
HNRNPMP52272 GAPVD1-209ENST00000436712 2490 ntTSL 510.41□□□□□ -0.746e-13■■■■■ 43.1
HNRNPMP52272 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.756e-13■■■■■ 43.1
HNRNPMP52272 GAPVD1-212ENST00000467750 3163 ntTSL 510.08□□□□□ -0.86e-13■■■■■ 43.1
HNRNPMP52272 GAPVD1-208ENST00000431329 2512 ntTSL 29.88□□□□□ -0.836e-13■■■■■ 43.1
HNRNPMP52272 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.856e-13■■■■■ 43.1
HNRNPMP52272 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.956e-13■■■■■ 43.1
HNRNPMP52272 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.996e-13■■■■■ 43.1
HNRNPMP52272 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.316e-13■■■■■ 43.1
HNRNPMP52272 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.945e-7■■■■■ 43
HNRNPMP52272 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.695e-7■■■■■ 43
HNRNPMP52272 TBC1D22A-204ENST00000394449 2048 ntTSL 530.27■■■□□ 2.445e-7■■■■■ 43
HNRNPMP52272 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 43
HNRNPMP52272 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.435e-7■■■■■ 43
HNRNPMP52272 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.071e-8■■■■■ 43
HNRNPMP52272 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.721e-8■■■■■ 43
HNRNPMP52272 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.631e-8■■■■■ 43
HNRNPMP52272 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.51e-8■■■■■ 43
HNRNPMP52272 AL136531.2-201ENST00000618770 1164 ntTSL 229.13■■■□□ 2.251e-8■■■■■ 43
HNRNPMP52272 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.61e-8■■■■■ 43
HNRNPMP52272 FKBP1A-209ENST00000612074 409 ntTSL 219.77■□□□□ 0.761e-8■■■■■ 43
HNRNPMP52272 FKBP1A-201ENST00000381715 705 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.691e-8■■■■■ 43
HNRNPMP52272 FKBP1A-202ENST00000381719 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21e-8■■■■■ 43
HNRNPMP52272 FKBP1A-203ENST00000381724 976 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.391e-8■■■■■ 43
HNRNPMP52272 ZNF787-201ENST00000586787 386 ntTSL 1 (best)28.99■■■□□ 2.234e-11■■■■■ 42.8
HNRNPMP52272 SHANK2-215ENST00000470759 762 ntTSL 529.42■■■□□ 2.38e-8■■■■■ 42.7
HNRNPMP52272 HTD2-207ENST00000498618 557 ntTSL 432.58■■■□□ 2.812e-10■■■■■ 42.6
HNRNPMP52272 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.092e-10■■■■■ 42.6
HNRNPMP52272 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.052e-10■■■■■ 42.6
HNRNPMP52272 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.982e-10■■■■■ 42.6
HNRNPMP52272 HTD2-202ENST00000474660 888 ntTSL 225.98■■□□□ 1.752e-10■■■■■ 42.6
HNRNPMP52272 RPP14-203ENST00000461797 531 ntTSL 425.98■■□□□ 1.752e-10■■■■■ 42.6
HNRNPMP52272 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.942e-10■■■■■ 42.6
HNRNPMP52272 HTD2-203ENST00000475412 648 ntTSL 318.65■□□□□ 0.582e-10■■■■■ 42.6
HNRNPMP52272 HTD2-204ENST00000476007 847 ntTSL 216.68■□□□□ 0.262e-10■■■■■ 42.6
HNRNPMP52272 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.162e-10■■■■■ 42.6
HNRNPMP52272 RPP14-201ENST00000295959 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.372e-10■■■■■ 42.6
HNRNPMP52272 RERE-211ENST00000469251 355 ntTSL 34.51□□□□□ -1.692e-7■■■■■ 42.5
HNRNPMP52272 WDR4-206ENST00000479429 759 ntTSL 534.76■■■■□ 3.165e-8■■■■■ 42.5
HNRNPMP52272 WDR4-203ENST00000463902 609 ntTSL 321.81■■□□□ 1.085e-8■■■■■ 42.5
HNRNPMP52272 PRPF40A-205ENST00000467114 546 ntTSL 45.7□□□□□ -1.54e-11■■■■■ 42.4
HNRNPMP52272 NLRP1-202ENST00000269280 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 42.4
HNRNPMP52272 NLRP1-205ENST00000544378 5281 ntTSL 216.2■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 42.4
HNRNPMP52272 NLRP1-208ENST00000571451 5444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 42.4
HNRNPMP52272 NLRP1-215ENST00000613500 4494 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 42.4
HNRNPMP52272 NLRP1-201ENST00000262467 5131 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 42.4
HNRNPMP52272 NLRP1-203ENST00000345221 4656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 42.4
HNRNPMP52272 NLRP1-217ENST00000619223 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 42.4
HNRNPMP52272 NLRP1-214ENST00000577119 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 42.4
HNRNPMP52272 NLRP1-216ENST00000617618 4788 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 42.4
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 417.4 ms