Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMTP48728 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMTP48728 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMTP48728 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMTP48728 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
AMTP48728 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMTP48728 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMTP48728 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMTP48728 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMTP48728 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMTP48728 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMTP48728 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMTP48728 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMTP48728 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AMTP48728 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AMTP48728 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMTP48728 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMTP48728 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMTP48728 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMTP48728 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMTP48728 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMTP48728 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMTP48728 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMTP48728 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMTP48728 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMTP48728 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMTP48728 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMTP48728 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMTP48728 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMTP48728 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AMTP48728 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMTP48728 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMTP48728 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AMTP48728 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
AMTP48728 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AMTP48728 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AMTP48728 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AMTP48728 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AMTP48728 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
AMTP48728 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AMTP48728 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AMTP48728 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMTP48728 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMTP48728 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AMTP48728 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMTP48728 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMTP48728 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMTP48728 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AMTP48728 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMTP48728 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMTP48728 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMTP48728 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMTP48728 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMTP48728 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMTP48728 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMTP48728 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AMTP48728 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AMTP48728 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AMTP48728 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AMTP48728 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AMTP48728 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AMTP48728 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AMTP48728 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AMTP48728 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AMTP48728 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AMTP48728 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AMTP48728 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AMTP48728 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AMTP48728 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AMTP48728 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AMTP48728 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AMTP48728 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
AMTP48728 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AMTP48728 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AMTP48728 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
AMTP48728 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
AMTP48728 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AMTP48728 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
AMTP48728 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AMTP48728 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
AMTP48728 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AMTP48728 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AMTP48728 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AMTP48728 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AMTP48728 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AMTP48728 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AMTP48728 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AMTP48728 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AMTP48728 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AMTP48728 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AMTP48728 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AMTP48728 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AMTP48728 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AMTP48728 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AMTP48728 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AMTP48728 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
AMTP48728 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
AMTP48728 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AMTP48728 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
AMTP48728 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms