Protein–RNA interactions for Protein: P43688

Nkx2-6, Homeobox protein Nkx-2.6, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-6P43688 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx2-6P43688 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nkx2-6P43688 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx2-6P43688 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx2-6P43688 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx2-6P43688 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx2-6P43688 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx2-6P43688 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx2-6P43688 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-6P43688 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx2-6P43688 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkx2-6P43688 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nkx2-6P43688 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx2-6P43688 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx2-6P43688 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx2-6P43688 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx2-6P43688 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx2-6P43688 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx2-6P43688 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx2-6P43688 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx2-6P43688 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx2-6P43688 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx2-6P43688 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx2-6P43688 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx2-6P43688 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx2-6P43688 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx2-6P43688 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx2-6P43688 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx2-6P43688 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx2-6P43688 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx2-6P43688 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx2-6P43688 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx2-6P43688 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx2-6P43688 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx2-6P43688 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx2-6P43688 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx2-6P43688 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx2-6P43688 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx2-6P43688 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx2-6P43688 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx2-6P43688 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx2-6P43688 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx2-6P43688 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx2-6P43688 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx2-6P43688 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx2-6P43688 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx2-6P43688 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx2-6P43688 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx2-6P43688 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx2-6P43688 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx2-6P43688 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx2-6P43688 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx2-6P43688 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx2-6P43688 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkx2-6P43688 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkx2-6P43688 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkx2-6P43688 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkx2-6P43688 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkx2-6P43688 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx2-6P43688 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx2-6P43688 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx2-6P43688 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkx2-6P43688 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkx2-6P43688 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx2-6P43688 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx2-6P43688 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx2-6P43688 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx2-6P43688 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx2-6P43688 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx2-6P43688 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx2-6P43688 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx2-6P43688 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkx2-6P43688 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkx2-6P43688 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkx2-6P43688 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx2-6P43688 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx2-6P43688 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx2-6P43688 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx2-6P43688 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx2-6P43688 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx2-6P43688 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx2-6P43688 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx2-6P43688 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx2-6P43688 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx2-6P43688 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx2-6P43688 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx2-6P43688 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx2-6P43688 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx2-6P43688 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx2-6P43688 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx2-6P43688 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx2-6P43688 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx2-6P43688 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx2-6P43688 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx2-6P43688 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx2-6P43688 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx2-6P43688 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx2-6P43688 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx2-6P43688 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx2-6P43688 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms