Protein–RNA interactions for Protein: P43241

Cdx2, Homeobox protein CDX-2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx2P43241 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdx2P43241 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdx2P43241 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdx2P43241 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdx2P43241 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdx2P43241 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdx2P43241 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdx2P43241 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdx2P43241 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdx2P43241 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdx2P43241 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdx2P43241 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdx2P43241 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdx2P43241 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdx2P43241 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdx2P43241 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdx2P43241 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdx2P43241 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdx2P43241 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdx2P43241 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdx2P43241 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdx2P43241 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdx2P43241 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdx2P43241 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdx2P43241 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdx2P43241 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdx2P43241 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdx2P43241 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdx2P43241 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdx2P43241 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdx2P43241 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdx2P43241 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdx2P43241 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdx2P43241 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdx2P43241 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdx2P43241 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdx2P43241 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdx2P43241 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdx2P43241 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdx2P43241 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdx2P43241 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdx2P43241 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdx2P43241 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdx2P43241 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdx2P43241 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdx2P43241 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdx2P43241 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdx2P43241 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdx2P43241 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdx2P43241 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdx2P43241 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdx2P43241 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdx2P43241 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdx2P43241 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdx2P43241 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdx2P43241 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdx2P43241 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdx2P43241 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdx2P43241 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdx2P43241 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdx2P43241 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdx2P43241 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdx2P43241 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdx2P43241 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdx2P43241 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdx2P43241 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdx2P43241 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdx2P43241 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdx2P43241 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdx2P43241 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdx2P43241 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdx2P43241 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdx2P43241 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdx2P43241 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdx2P43241 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdx2P43241 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdx2P43241 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdx2P43241 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdx2P43241 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdx2P43241 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdx2P43241 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdx2P43241 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdx2P43241 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdx2P43241 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdx2P43241 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdx2P43241 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdx2P43241 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdx2P43241 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdx2P43241 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdx2P43241 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdx2P43241 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdx2P43241 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdx2P43241 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdx2P43241 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdx2P43241 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdx2P43241 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdx2P43241 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdx2P43241 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdx2P43241 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdx2P43241 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.9 ms