Protein–RNA interactions for Protein: P36026

UBP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, yeastyeast

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP11P36026 ESS1YJR017C 513 nt10.2□□□□□ -0.78
UBP11P36026 SSN3YPL042C 1668 nt10.2□□□□□ -0.78
UBP11P36026 BNI5YNL166C 1347 nt10.19□□□□□ -0.78
UBP11P36026 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10.18□□□□□ -0.78
UBP11P36026 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.18□□□□□ -0.78
UBP11P36026 SAM3YPL274W 1764 nt10.18□□□□□ -0.78
UBP11P36026 YJL118WYJL118W 660 nt10.17□□□□□ -0.78
UBP11P36026 GAL3YDR009W 1563 nt10.15□□□□□ -0.78
UBP11P36026 CCT5YJR064W 1689 nt10.15□□□□□ -0.79
UBP11P36026 PHO23YNL097C 993 nt10.14□□□□□ -0.79
UBP11P36026 LSB5YCL034W 1065 nt10.14□□□□□ -0.79
UBP11P36026 URA6YKL024C 615 nt10.11□□□□□ -0.79
UBP11P36026 OYE3YPL171C 1203 nt10.11□□□□□ -0.79
UBP11P36026 MSC1YML128C 1542 nt10.11□□□□□ -0.79
UBP11P36026 RPT5YOR117W 1305 nt10.1□□□□□ -0.79
UBP11P36026 SNZ1YMR096W 894 nt10.1□□□□□ -0.79
UBP11P36026 NUC1YJL208C 990 nt10.09□□□□□ -0.79
UBP11P36026 PGC1YPL206C 966 nt10.09□□□□□ -0.79
UBP11P36026 PAU5YFL020C 369 nt10.08□□□□□ -0.8
UBP11P36026 SEC61YLR378C 1443 nt10.07□□□□□ -0.8
UBP11P36026 ZRT3YKL175W 1512 nt10.07□□□□□ -0.8
UBP11P36026 FUB1YCR076C 753 nt10.06□□□□□ -0.8
UBP11P36026 FLR1YBR008C 1647 nt10.06□□□□□ -0.8
UBP11P36026 NAR1YNL240C 1476 nt10.05□□□□□ -0.8
UBP11P36026 TPS1YBR126C 1488 nt10.05□□□□□ -0.8
UBP11P36026 SAM2YDR502C 1155 nt10.05□□□□□ -0.8
UBP11P36026 PBP1YGR178C 2169 nt10.04□□□□□ -0.8
UBP11P36026 YJL067WYJL067W 351 nt10.04□□□□□ -0.8
UBP11P36026 THI72YOR192C 1800 nt10.03□□□□□ -0.8
UBP11P36026 OXA1YER154W 1209 nt10.03□□□□□ -0.8
UBP11P36026 PET8YNL003C 855 nt10.03□□□□□ -0.8
UBP11P36026 SEN2YLR105C 1134 nt10.02□□□□□ -0.81
UBP11P36026 RAS2YNL098C 969 nt10.02□□□□□ -0.81
UBP11P36026 RIB7YBR153W 735 nt10.02□□□□□ -0.81
UBP11P36026 DLD2YDL178W 1593 nt10.01□□□□□ -0.81
UBP11P36026 YER188WYER188W 720 nt10.01□□□□□ -0.81
UBP11P36026 YBR232CYBR232C 360 nt10.01□□□□□ -0.81
UBP11P36026 EAF3YPR023C 1206 nt9.99□□□□□ -0.81
UBP11P36026 OYE2YHR179W 1203 nt9.98□□□□□ -0.81
UBP11P36026 FMS1YMR020W 1527 nt9.97□□□□□ -0.81
UBP11P36026 STP3YLR375W 1032 nt9.96□□□□□ -0.82
UBP11P36026 HEM13YDR044W 987 nt9.95□□□□□ -0.82
UBP11P36026 YMR262WYMR262W 942 nt9.95□□□□□ -0.82
UBP11P36026 PUP1YOR157C 786 nt9.95□□□□□ -0.82
UBP11P36026 YPR126CYPR126C 309 nt9.95□□□□□ -0.82
UBP11P36026 YPS3YLR121C 1527 nt9.95□□□□□ -0.82
UBP11P36026 FRE6YLL051C 2139 nt9.94□□□□□ -0.82
UBP11P36026 TAF13YML098W 504 nt9.94□□□□□ -0.82
UBP11P36026 RSC8YFR037C 1674 nt9.93□□□□□ -0.82
UBP11P36026 CYT2YKL087C 675 nt9.92□□□□□ -0.82
UBP11P36026 DAK2YFL053W 1776 nt9.92□□□□□ -0.82
UBP11P36026 DDI1YER143W 1287 nt9.91□□□□□ -0.82
UBP11P36026 YJL064WYJL064W 396 nt9.91□□□□□ -0.82
UBP11P36026 TMA23YMR269W 636 nt9.91□□□□□ -0.82
UBP11P36026 CTI6YPL181W 1521 nt9.91□□□□□ -0.82
UBP11P36026 SPP2YOR148C 558 nt9.9□□□□□ -0.82
UBP11P36026 OSH7YHR001W 1314 nt9.89□□□□□ -0.83
UBP11P36026 MHF1YOL086W-A 273 nt9.89□□□□□ -0.83
UBP11P36026 HSL7YBR133C 2484 nt9.89□□□□□ -0.83
UBP11P36026 TAT2YOL020W 1779 nt9.88□□□□□ -0.83
UBP11P36026 SOL2YCR073W-A 948 nt9.88□□□□□ -0.83
UBP11P36026 NAP1YKR048C 1254 nt9.88□□□□□ -0.83
UBP11P36026 YDR455CYDR455C 309 nt9.87□□□□□ -0.83
UBP11P36026 LSM5YER146W 282 nt9.87□□□□□ -0.83
UBP11P36026 ACH1YBL015W 1581 nt9.87□□□□□ -0.83
UBP11P36026 POT1YIL160C 1254 nt9.86□□□□□ -0.83
UBP11P36026 APS2YJR058C 444 nt9.86□□□□□ -0.83
UBP11P36026 CMP2YML057W 1815 nt9.85□□□□□ -0.83
UBP11P36026 CWC15YDR163W 528 nt9.84□□□□□ -0.83
UBP11P36026 YAT1YAR035W 2064 nt9.83□□□□□ -0.84
UBP11P36026 NIF3YGL221C 867 nt9.83□□□□□ -0.84
UBP11P36026 PAU19YMR325W 375 nt9.83□□□□□ -0.84
UBP11P36026 IML3YBR107C 738 nt9.83□□□□□ -0.84
UBP11P36026 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.82□□□□□ -0.84
UBP11P36026 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.82□□□□□ -0.84
UBP11P36026 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt9.82□□□□□ -0.84
UBP11P36026 TUB4YLR212C 1422 nt9.82□□□□□ -0.84
UBP11P36026 IMO32YGR031W 1029 nt9.81□□□□□ -0.84
UBP11P36026 YNL024CYNL024C 741 nt9.81□□□□□ -0.84
UBP11P36026 GSF2YML048W 1212 nt9.79□□□□□ -0.84
UBP11P36026 SLG1YOR008C 1137 nt9.77□□□□□ -0.85
UBP11P36026 PAR32YDL173W 888 nt9.75□□□□□ -0.85
UBP11P36026 SPS100YHR139C 981 nt9.74□□□□□ -0.85
UBP11P36026 ERG13YML126C 1476 nt9.72□□□□□ -0.85
UBP11P36026 TIP1YBR067C 633 nt9.72□□□□□ -0.85
UBP11P36026 VPS62YGR141W 1404 nt9.72□□□□□ -0.85
UBP11P36026 ASP3-1YLR155C 1089 nt9.7□□□□□ -0.86
UBP11P36026 ASP3-2YLR157C 1089 nt9.7□□□□□ -0.86
UBP11P36026 ASP3-3YLR158C 1089 nt9.7□□□□□ -0.86
UBP11P36026 ASP3-4YLR160C 1089 nt9.7□□□□□ -0.86
UBP11P36026 CDD1YLR245C 429 nt9.7□□□□□ -0.86
UBP11P36026 RRT8YOL048C 1029 nt9.7□□□□□ -0.86
UBP11P36026 RPC82YPR190C 1965 nt9.7□□□□□ -0.86
UBP11P36026 HEL2YDR266C 1920 nt9.69□□□□□ -0.86
UBP11P36026 YOR325WYOR325W 474 nt9.69□□□□□ -0.86
UBP11P36026 INA1YLR413W 2028 nt9.68□□□□□ -0.86
UBP11P36026 ADE8YDR408C 645 nt9.68□□□□□ -0.86
UBP11P36026 NAS2YIL007C 663 nt9.68□□□□□ -0.86
UBP11P36026 IGD1YFR017C 588 nt9.67□□□□□ -0.86
UBP11P36026 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.66□□□□□ -0.86
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