Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ptpn11P35235 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ptpn11P35235 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ptpn11P35235 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ptpn11P35235 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ptpn11P35235 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ptpn11P35235 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ptpn11P35235 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ptpn11P35235 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ptpn11P35235 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ptpn11P35235 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ptpn11P35235 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ptpn11P35235 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ptpn11P35235 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ptpn11P35235 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ptpn11P35235 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ptpn11P35235 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ptpn11P35235 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ptpn11P35235 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ptpn11P35235 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ptpn11P35235 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ptpn11P35235 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ptpn11P35235 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ptpn11P35235 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ptpn11P35235 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ptpn11P35235 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ptpn11P35235 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ptpn11P35235 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ptpn11P35235 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ptpn11P35235 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ptpn11P35235 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ptpn11P35235 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ptpn11P35235 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ptpn11P35235 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ptpn11P35235 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ptpn11P35235 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ptpn11P35235 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ptpn11P35235 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ptpn11P35235 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ptpn11P35235 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ptpn11P35235 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ptpn11P35235 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ptpn11P35235 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ptpn11P35235 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ptpn11P35235 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ptpn11P35235 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ptpn11P35235 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ptpn11P35235 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ptpn11P35235 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ptpn11P35235 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ptpn11P35235 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ptpn11P35235 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ptpn11P35235 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ptpn11P35235 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ptpn11P35235 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ptpn11P35235 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ptpn11P35235 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ptpn11P35235 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ptpn11P35235 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ptpn11P35235 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ptpn11P35235 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ptpn11P35235 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ptpn11P35235 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ptpn11P35235 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ptpn11P35235 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ptpn11P35235 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ptpn11P35235 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ptpn11P35235 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ptpn11P35235 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ptpn11P35235 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ptpn11P35235 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ptpn11P35235 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ptpn11P35235 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ptpn11P35235 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ptpn11P35235 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ptpn11P35235 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ptpn11P35235 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ptpn11P35235 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ptpn11P35235 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ptpn11P35235 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ptpn11P35235 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ptpn11P35235 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ptpn11P35235 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ptpn11P35235 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ptpn11P35235 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ptpn11P35235 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ptpn11P35235 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ptpn11P35235 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ptpn11P35235 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ptpn11P35235 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ptpn11P35235 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ptpn11P35235 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ptpn11P35235 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ptpn11P35235 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ptpn11P35235 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ptpn11P35235 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ptpn11P35235 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ptpn11P35235 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ptpn11P35235 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ptpn11P35235 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms