Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cbx2P30658 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cbx2P30658 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cbx2P30658 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cbx2P30658 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cbx2P30658 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cbx2P30658 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cbx2P30658 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cbx2P30658 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cbx2P30658 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cbx2P30658 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cbx2P30658 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cbx2P30658 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cbx2P30658 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cbx2P30658 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cbx2P30658 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cbx2P30658 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cbx2P30658 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cbx2P30658 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cbx2P30658 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cbx2P30658 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cbx2P30658 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cbx2P30658 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cbx2P30658 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cbx2P30658 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cbx2P30658 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cbx2P30658 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cbx2P30658 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cbx2P30658 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cbx2P30658 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cbx2P30658 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cbx2P30658 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cbx2P30658 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cbx2P30658 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cbx2P30658 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cbx2P30658 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cbx2P30658 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cbx2P30658 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cbx2P30658 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cbx2P30658 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cbx2P30658 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cbx2P30658 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cbx2P30658 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cbx2P30658 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cbx2P30658 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Cbx2P30658 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Cbx2P30658 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cbx2P30658 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cbx2P30658 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cbx2P30658 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cbx2P30658 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cbx2P30658 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cbx2P30658 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cbx2P30658 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cbx2P30658 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cbx2P30658 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cbx2P30658 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cbx2P30658 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cbx2P30658 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cbx2P30658 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cbx2P30658 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cbx2P30658 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cbx2P30658 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cbx2P30658 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Cbx2P30658 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cbx2P30658 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cbx2P30658 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cbx2P30658 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cbx2P30658 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cbx2P30658 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cbx2P30658 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cbx2P30658 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cbx2P30658 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cbx2P30658 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cbx2P30658 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cbx2P30658 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cbx2P30658 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cbx2P30658 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cbx2P30658 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cbx2P30658 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cbx2P30658 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cbx2P30658 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cbx2P30658 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cbx2P30658 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cbx2P30658 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cbx2P30658 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cbx2P30658 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Cbx2P30658 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cbx2P30658 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cbx2P30658 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cbx2P30658 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cbx2P30658 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cbx2P30658 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cbx2P30658 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cbx2P30658 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cbx2P30658 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cbx2P30658 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Cbx2P30658 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cbx2P30658 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cbx2P30658 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms