Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRIP30626 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRIP30626 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRIP30626 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRIP30626 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRIP30626 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRIP30626 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRIP30626 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRIP30626 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRIP30626 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRIP30626 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRIP30626 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRIP30626 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRIP30626 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRIP30626 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRIP30626 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRIP30626 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRIP30626 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRIP30626 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRIP30626 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRIP30626 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRIP30626 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRIP30626 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRIP30626 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRIP30626 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRIP30626 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRIP30626 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRIP30626 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRIP30626 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRIP30626 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRIP30626 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRIP30626 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRIP30626 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRIP30626 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRIP30626 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRIP30626 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRIP30626 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRIP30626 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRIP30626 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SRIP30626 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRIP30626 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRIP30626 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRIP30626 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRIP30626 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRIP30626 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRIP30626 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRIP30626 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRIP30626 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRIP30626 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRIP30626 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRIP30626 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRIP30626 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRIP30626 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRIP30626 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRIP30626 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRIP30626 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRIP30626 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRIP30626 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SRIP30626 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRIP30626 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRIP30626 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRIP30626 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRIP30626 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRIP30626 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRIP30626 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRIP30626 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRIP30626 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRIP30626 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRIP30626 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRIP30626 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRIP30626 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRIP30626 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRIP30626 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRIP30626 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SRIP30626 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRIP30626 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRIP30626 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRIP30626 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRIP30626 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRIP30626 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRIP30626 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRIP30626 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRIP30626 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRIP30626 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRIP30626 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRIP30626 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRIP30626 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRIP30626 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRIP30626 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRIP30626 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRIP30626 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRIP30626 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRIP30626 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRIP30626 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRIP30626 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRIP30626 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRIP30626 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRIP30626 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRIP30626 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRIP30626 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms