Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col2a1P28481 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Col2a1P28481 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col2a1P28481 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col2a1P28481 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col2a1P28481 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col2a1P28481 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col2a1P28481 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col2a1P28481 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col2a1P28481 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Col2a1P28481 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Col2a1P28481 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Col2a1P28481 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Col2a1P28481 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Col2a1P28481 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Col2a1P28481 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Col2a1P28481 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Col2a1P28481 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Col2a1P28481 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Col2a1P28481 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col2a1P28481 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col2a1P28481 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col2a1P28481 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col2a1P28481 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Col2a1P28481 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Col2a1P28481 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Col2a1P28481 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Col2a1P28481 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col2a1P28481 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col2a1P28481 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Col2a1P28481 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Col2a1P28481 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Col2a1P28481 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Col2a1P28481 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Col2a1P28481 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Col2a1P28481 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Col2a1P28481 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col2a1P28481 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Col2a1P28481 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col2a1P28481 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col2a1P28481 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Col2a1P28481 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col2a1P28481 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col2a1P28481 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col2a1P28481 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col2a1P28481 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Col2a1P28481 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col2a1P28481 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Col2a1P28481 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Col2a1P28481 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Col2a1P28481 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col2a1P28481 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col2a1P28481 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col2a1P28481 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col2a1P28481 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Col2a1P28481 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Col2a1P28481 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Col2a1P28481 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Col2a1P28481 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col2a1P28481 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col2a1P28481 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col2a1P28481 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col2a1P28481 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Col2a1P28481 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Col2a1P28481 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Col2a1P28481 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col2a1P28481 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col2a1P28481 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col2a1P28481 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col2a1P28481 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Col2a1P28481 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Col2a1P28481 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Col2a1P28481 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Col2a1P28481 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Col2a1P28481 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col2a1P28481 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col2a1P28481 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Col2a1P28481 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Col2a1P28481 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col2a1P28481 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col2a1P28481 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col2a1P28481 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Col2a1P28481 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Col2a1P28481 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col2a1P28481 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Col2a1P28481 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Col2a1P28481 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Col2a1P28481 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col2a1P28481 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col2a1P28481 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col2a1P28481 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Col2a1P28481 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col2a1P28481 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col2a1P28481 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col2a1P28481 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col2a1P28481 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Col2a1P28481 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Col2a1P28481 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Col2a1P28481 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col2a1P28481 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms