Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Gria2P23819 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gria2P23819 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gria2P23819 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gria2P23819 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gria2P23819 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gria2P23819 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gria2P23819 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gria2P23819 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gria2P23819 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gria2P23819 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Gria2P23819 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gria2P23819 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gria2P23819 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gria2P23819 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gria2P23819 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gria2P23819 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gria2P23819 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gria2P23819 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gria2P23819 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gria2P23819 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gria2P23819 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gria2P23819 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gria2P23819 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gria2P23819 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gria2P23819 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gria2P23819 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gria2P23819 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gria2P23819 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gria2P23819 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gria2P23819 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gria2P23819 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gria2P23819 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gria2P23819 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gria2P23819 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gria2P23819 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gria2P23819 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gria2P23819 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gria2P23819 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gria2P23819 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gria2P23819 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gria2P23819 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gria2P23819 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gria2P23819 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gria2P23819 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gria2P23819 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gria2P23819 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gria2P23819 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gria2P23819 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gria2P23819 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gria2P23819 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gria2P23819 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gria2P23819 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gria2P23819 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gria2P23819 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gria2P23819 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gria2P23819 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gria2P23819 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gria2P23819 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gria2P23819 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gria2P23819 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gria2P23819 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gria2P23819 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gria2P23819 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gria2P23819 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gria2P23819 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gria2P23819 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gria2P23819 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gria2P23819 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gria2P23819 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gria2P23819 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gria2P23819 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gria2P23819 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gria2P23819 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gria2P23819 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gria2P23819 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gria2P23819 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gria2P23819 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gria2P23819 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gria2P23819 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gria2P23819 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gria2P23819 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gria2P23819 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gria2P23819 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gria2P23819 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gria2P23819 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gria2P23819 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gria2P23819 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gria2P23819 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gria2P23819 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gria2P23819 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gria2P23819 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gria2P23819 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gria2P23819 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gria2P23819 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gria2P23819 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gria2P23819 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gria2P23819 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gria2P23819 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gria2P23819 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms