Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RarbP22605 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RarbP22605 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RarbP22605 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RarbP22605 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RarbP22605 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RarbP22605 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RarbP22605 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RarbP22605 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RarbP22605 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RarbP22605 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RarbP22605 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RarbP22605 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RarbP22605 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RarbP22605 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RarbP22605 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RarbP22605 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RarbP22605 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RarbP22605 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RarbP22605 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RarbP22605 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RarbP22605 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RarbP22605 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RarbP22605 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RarbP22605 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RarbP22605 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RarbP22605 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RarbP22605 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RarbP22605 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RarbP22605 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RarbP22605 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RarbP22605 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RarbP22605 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RarbP22605 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RarbP22605 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RarbP22605 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RarbP22605 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RarbP22605 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RarbP22605 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RarbP22605 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RarbP22605 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RarbP22605 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RarbP22605 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RarbP22605 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RarbP22605 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RarbP22605 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RarbP22605 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RarbP22605 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RarbP22605 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RarbP22605 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RarbP22605 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RarbP22605 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RarbP22605 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RarbP22605 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RarbP22605 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RarbP22605 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RarbP22605 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RarbP22605 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RarbP22605 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RarbP22605 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RarbP22605 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RarbP22605 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RarbP22605 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RarbP22605 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RarbP22605 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RarbP22605 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RarbP22605 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RarbP22605 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RarbP22605 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RarbP22605 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RarbP22605 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RarbP22605 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RarbP22605 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RarbP22605 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RarbP22605 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RarbP22605 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RarbP22605 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
RarbP22605 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RarbP22605 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RarbP22605 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RarbP22605 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RarbP22605 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RarbP22605 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RarbP22605 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RarbP22605 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RarbP22605 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RarbP22605 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RarbP22605 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RarbP22605 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RarbP22605 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RarbP22605 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RarbP22605 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RarbP22605 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RarbP22605 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RarbP22605 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RarbP22605 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RarbP22605 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RarbP22605 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RarbP22605 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RarbP22605 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms