Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NefhP19246 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NefhP19246 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NefhP19246 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NefhP19246 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NefhP19246 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NefhP19246 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NefhP19246 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NefhP19246 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NefhP19246 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NefhP19246 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NefhP19246 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NefhP19246 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NefhP19246 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NefhP19246 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NefhP19246 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NefhP19246 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NefhP19246 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NefhP19246 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NefhP19246 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NefhP19246 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NefhP19246 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NefhP19246 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NefhP19246 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NefhP19246 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NefhP19246 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NefhP19246 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NefhP19246 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NefhP19246 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NefhP19246 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NefhP19246 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NefhP19246 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NefhP19246 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NefhP19246 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NefhP19246 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NefhP19246 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NefhP19246 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NefhP19246 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NefhP19246 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NefhP19246 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NefhP19246 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NefhP19246 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NefhP19246 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NefhP19246 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NefhP19246 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NefhP19246 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NefhP19246 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NefhP19246 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NefhP19246 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NefhP19246 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NefhP19246 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NefhP19246 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NefhP19246 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
NefhP19246 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NefhP19246 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NefhP19246 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NefhP19246 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NefhP19246 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NefhP19246 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NefhP19246 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NefhP19246 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NefhP19246 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NefhP19246 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NefhP19246 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NefhP19246 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NefhP19246 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NefhP19246 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NefhP19246 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NefhP19246 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NefhP19246 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NefhP19246 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NefhP19246 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NefhP19246 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NefhP19246 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NefhP19246 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NefhP19246 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NefhP19246 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NefhP19246 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NefhP19246 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NefhP19246 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NefhP19246 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NefhP19246 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NefhP19246 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NefhP19246 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NefhP19246 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NefhP19246 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NefhP19246 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NefhP19246 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NefhP19246 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NefhP19246 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NefhP19246 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NefhP19246 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NefhP19246 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NefhP19246 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NefhP19246 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NefhP19246 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NefhP19246 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NefhP19246 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NefhP19246 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NefhP19246 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms