Protein–RNA interactions for Protein: P16402

HIST1H1D, Histone H1.3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H1DP16402 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HIST1H1DP16402 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST1H1DP16402 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST1H1DP16402 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST1H1DP16402 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST1H1DP16402 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIST1H1DP16402 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIST1H1DP16402 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIST1H1DP16402 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIST1H1DP16402 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIST1H1DP16402 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIST1H1DP16402 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIST1H1DP16402 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIST1H1DP16402 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST1H1DP16402 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST1H1DP16402 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST1H1DP16402 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST1H1DP16402 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST1H1DP16402 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST1H1DP16402 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST1H1DP16402 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST1H1DP16402 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST1H1DP16402 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST1H1DP16402 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST1H1DP16402 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST1H1DP16402 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST1H1DP16402 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST1H1DP16402 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST1H1DP16402 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST1H1DP16402 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST1H1DP16402 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIST1H1DP16402 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HIST1H1DP16402 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIST1H1DP16402 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIST1H1DP16402 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIST1H1DP16402 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIST1H1DP16402 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIST1H1DP16402 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIST1H1DP16402 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIST1H1DP16402 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIST1H1DP16402 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIST1H1DP16402 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST1H1DP16402 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST1H1DP16402 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST1H1DP16402 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST1H1DP16402 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST1H1DP16402 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST1H1DP16402 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIST1H1DP16402 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIST1H1DP16402 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIST1H1DP16402 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST1H1DP16402 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST1H1DP16402 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST1H1DP16402 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST1H1DP16402 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST1H1DP16402 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST1H1DP16402 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIST1H1DP16402 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIST1H1DP16402 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIST1H1DP16402 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST1H1DP16402 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIST1H1DP16402 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIST1H1DP16402 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIST1H1DP16402 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIST1H1DP16402 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIST1H1DP16402 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HIST1H1DP16402 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIST1H1DP16402 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIST1H1DP16402 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIST1H1DP16402 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIST1H1DP16402 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIST1H1DP16402 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIST1H1DP16402 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIST1H1DP16402 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIST1H1DP16402 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIST1H1DP16402 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIST1H1DP16402 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms