Protein–RNA interactions for Protein: P0C872

Jmjd7, JmjC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd7P0C872 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Jmjd7P0C872 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Jmjd7P0C872 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Jmjd7P0C872 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Jmjd7P0C872 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Jmjd7P0C872 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Jmjd7P0C872 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Jmjd7P0C872 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Jmjd7P0C872 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Jmjd7P0C872 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Jmjd7P0C872 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Jmjd7P0C872 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Jmjd7P0C872 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Jmjd7P0C872 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Jmjd7P0C872 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Jmjd7P0C872 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Jmjd7P0C872 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Jmjd7P0C872 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Jmjd7P0C872 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Jmjd7P0C872 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Jmjd7P0C872 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Jmjd7P0C872 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Jmjd7P0C872 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Jmjd7P0C872 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Jmjd7P0C872 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Jmjd7P0C872 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Jmjd7P0C872 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Jmjd7P0C872 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Jmjd7P0C872 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Jmjd7P0C872 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Jmjd7P0C872 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Jmjd7P0C872 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Jmjd7P0C872 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Jmjd7P0C872 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Jmjd7P0C872 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Jmjd7P0C872 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Jmjd7P0C872 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Jmjd7P0C872 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Jmjd7P0C872 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Jmjd7P0C872 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Jmjd7P0C872 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Jmjd7P0C872 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Jmjd7P0C872 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Jmjd7P0C872 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Jmjd7P0C872 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Jmjd7P0C872 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Jmjd7P0C872 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Jmjd7P0C872 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Jmjd7P0C872 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Jmjd7P0C872 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Jmjd7P0C872 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Jmjd7P0C872 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Jmjd7P0C872 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Jmjd7P0C872 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Jmjd7P0C872 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Jmjd7P0C872 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Jmjd7P0C872 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Jmjd7P0C872 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd7P0C872 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd7P0C872 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jmjd7P0C872 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jmjd7P0C872 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jmjd7P0C872 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jmjd7P0C872 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Jmjd7P0C872 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Jmjd7P0C872 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Jmjd7P0C872 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Jmjd7P0C872 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Jmjd7P0C872 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Jmjd7P0C872 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Jmjd7P0C872 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Jmjd7P0C872 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Jmjd7P0C872 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Jmjd7P0C872 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Jmjd7P0C872 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd7P0C872 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd7P0C872 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd7P0C872 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd7P0C872 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Jmjd7P0C872 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Jmjd7P0C872 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Jmjd7P0C872 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Jmjd7P0C872 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Jmjd7P0C872 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Jmjd7P0C872 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Jmjd7P0C872 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Jmjd7P0C872 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Jmjd7P0C872 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Jmjd7P0C872 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Jmjd7P0C872 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Jmjd7P0C872 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Jmjd7P0C872 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Jmjd7P0C872 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Jmjd7P0C872 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd7P0C872 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd7P0C872 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Jmjd7P0C872 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Jmjd7P0C872 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd7P0C872 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd7P0C872 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms