Protein–RNA interactions for Protein: P08414

Camk4, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camk4P08414 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Camk4P08414 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Camk4P08414 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Camk4P08414 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Camk4P08414 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Camk4P08414 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Camk4P08414 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Camk4P08414 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Camk4P08414 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Camk4P08414 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Camk4P08414 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Camk4P08414 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Camk4P08414 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Camk4P08414 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Camk4P08414 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Camk4P08414 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Camk4P08414 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Camk4P08414 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Camk4P08414 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Camk4P08414 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Camk4P08414 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Camk4P08414 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Camk4P08414 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Camk4P08414 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Camk4P08414 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Camk4P08414 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Camk4P08414 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Camk4P08414 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Camk4P08414 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Camk4P08414 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Camk4P08414 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Camk4P08414 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Camk4P08414 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Camk4P08414 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Camk4P08414 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Camk4P08414 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Camk4P08414 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Camk4P08414 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Camk4P08414 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Camk4P08414 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Camk4P08414 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Camk4P08414 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Camk4P08414 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Camk4P08414 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Camk4P08414 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Camk4P08414 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Camk4P08414 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Camk4P08414 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Camk4P08414 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Camk4P08414 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Camk4P08414 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Camk4P08414 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Camk4P08414 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Camk4P08414 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Camk4P08414 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Camk4P08414 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Camk4P08414 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Camk4P08414 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Camk4P08414 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Camk4P08414 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Camk4P08414 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Camk4P08414 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Camk4P08414 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Camk4P08414 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Camk4P08414 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Camk4P08414 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Camk4P08414 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Camk4P08414 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Camk4P08414 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Camk4P08414 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Camk4P08414 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Camk4P08414 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Camk4P08414 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Camk4P08414 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Camk4P08414 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Camk4P08414 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Camk4P08414 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Camk4P08414 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Camk4P08414 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Camk4P08414 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Camk4P08414 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Camk4P08414 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Camk4P08414 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Camk4P08414 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Camk4P08414 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Camk4P08414 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Camk4P08414 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Camk4P08414 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Camk4P08414 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Camk4P08414 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Camk4P08414 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Camk4P08414 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Camk4P08414 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Camk4P08414 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Camk4P08414 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Camk4P08414 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Camk4P08414 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Camk4P08414 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Camk4P08414 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Camk4P08414 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms