Protein–RNA interactions for Protein: O95876

WDPCP, WD repeat-containing and planar cell polarity effector protein fritz homolog, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDPCPO95876 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDPCPO95876 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDPCPO95876 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDPCPO95876 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDPCPO95876 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDPCPO95876 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDPCPO95876 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDPCPO95876 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDPCPO95876 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
WDPCPO95876 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDPCPO95876 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDPCPO95876 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDPCPO95876 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDPCPO95876 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDPCPO95876 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDPCPO95876 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDPCPO95876 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDPCPO95876 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
WDPCPO95876 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDPCPO95876 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
WDPCPO95876 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
WDPCPO95876 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDPCPO95876 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDPCPO95876 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDPCPO95876 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDPCPO95876 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDPCPO95876 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDPCPO95876 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDPCPO95876 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDPCPO95876 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDPCPO95876 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
WDPCPO95876 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDPCPO95876 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDPCPO95876 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
WDPCPO95876 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDPCPO95876 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDPCPO95876 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDPCPO95876 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDPCPO95876 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDPCPO95876 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDPCPO95876 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDPCPO95876 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDPCPO95876 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDPCPO95876 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDPCPO95876 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDPCPO95876 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDPCPO95876 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
WDPCPO95876 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDPCPO95876 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDPCPO95876 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDPCPO95876 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDPCPO95876 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
WDPCPO95876 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDPCPO95876 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDPCPO95876 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
WDPCPO95876 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDPCPO95876 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDPCPO95876 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDPCPO95876 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDPCPO95876 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDPCPO95876 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDPCPO95876 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDPCPO95876 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDPCPO95876 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDPCPO95876 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDPCPO95876 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDPCPO95876 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDPCPO95876 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
WDPCPO95876 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDPCPO95876 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDPCPO95876 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDPCPO95876 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDPCPO95876 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDPCPO95876 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDPCPO95876 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDPCPO95876 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDPCPO95876 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDPCPO95876 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDPCPO95876 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDPCPO95876 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDPCPO95876 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDPCPO95876 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDPCPO95876 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDPCPO95876 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDPCPO95876 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDPCPO95876 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDPCPO95876 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDPCPO95876 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDPCPO95876 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDPCPO95876 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDPCPO95876 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDPCPO95876 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDPCPO95876 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDPCPO95876 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDPCPO95876 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDPCPO95876 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDPCPO95876 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDPCPO95876 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDPCPO95876 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDPCPO95876 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms