Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOL3O95236 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOL3O95236 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOL3O95236 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
APOL3O95236 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
APOL3O95236 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOL3O95236 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOL3O95236 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOL3O95236 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOL3O95236 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOL3O95236 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOL3O95236 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOL3O95236 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOL3O95236 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOL3O95236 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOL3O95236 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOL3O95236 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOL3O95236 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOL3O95236 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOL3O95236 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOL3O95236 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOL3O95236 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOL3O95236 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOL3O95236 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOL3O95236 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOL3O95236 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOL3O95236 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOL3O95236 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOL3O95236 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOL3O95236 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOL3O95236 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOL3O95236 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOL3O95236 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOL3O95236 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOL3O95236 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOL3O95236 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
APOL3O95236 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOL3O95236 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL3O95236 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL3O95236 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL3O95236 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOL3O95236 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOL3O95236 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOL3O95236 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOL3O95236 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOL3O95236 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APOL3O95236 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOL3O95236 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOL3O95236 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOL3O95236 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOL3O95236 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOL3O95236 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOL3O95236 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOL3O95236 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOL3O95236 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOL3O95236 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOL3O95236 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOL3O95236 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOL3O95236 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOL3O95236 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOL3O95236 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOL3O95236 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOL3O95236 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOL3O95236 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOL3O95236 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL3O95236 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL3O95236 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL3O95236 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL3O95236 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL3O95236 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL3O95236 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
APOL3O95236 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOL3O95236 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOL3O95236 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOL3O95236 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOL3O95236 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOL3O95236 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOL3O95236 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOL3O95236 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOL3O95236 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOL3O95236 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOL3O95236 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOL3O95236 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOL3O95236 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOL3O95236 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOL3O95236 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOL3O95236 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOL3O95236 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
APOL3O95236 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOL3O95236 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOL3O95236 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOL3O95236 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOL3O95236 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOL3O95236 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOL3O95236 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOL3O95236 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOL3O95236 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOL3O95236 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOL3O95236 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOL3O95236 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms