Protein–RNA interactions for Protein: O88667

Rrad, GTP-binding protein RAD, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RradO88667 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RradO88667 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RradO88667 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RradO88667 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RradO88667 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RradO88667 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RradO88667 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RradO88667 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RradO88667 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RradO88667 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RradO88667 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RradO88667 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RradO88667 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RradO88667 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RradO88667 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RradO88667 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RradO88667 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RradO88667 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RradO88667 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RradO88667 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RradO88667 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RradO88667 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RradO88667 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RradO88667 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RradO88667 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RradO88667 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RradO88667 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RradO88667 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RradO88667 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RradO88667 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RradO88667 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RradO88667 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RradO88667 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RradO88667 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RradO88667 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RradO88667 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RradO88667 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RradO88667 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RradO88667 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RradO88667 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RradO88667 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RradO88667 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RradO88667 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RradO88667 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RradO88667 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RradO88667 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RradO88667 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RradO88667 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RradO88667 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RradO88667 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RradO88667 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RradO88667 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RradO88667 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RradO88667 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RradO88667 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RradO88667 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RradO88667 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RradO88667 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RradO88667 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RradO88667 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RradO88667 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RradO88667 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RradO88667 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RradO88667 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RradO88667 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RradO88667 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RradO88667 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RradO88667 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RradO88667 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RradO88667 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RradO88667 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RradO88667 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RradO88667 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RradO88667 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RradO88667 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RradO88667 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RradO88667 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RradO88667 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RradO88667 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RradO88667 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RradO88667 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RradO88667 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RradO88667 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RradO88667 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RradO88667 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RradO88667 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RradO88667 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RradO88667 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RradO88667 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RradO88667 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RradO88667 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RradO88667 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RradO88667 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RradO88667 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RradO88667 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RradO88667 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RradO88667 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RradO88667 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RradO88667 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RradO88667 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms