Protein–RNA interactions for Protein: O88667

Rrad, GTP-binding protein RAD, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RradO88667 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
RradO88667 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RradO88667 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RradO88667 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
RradO88667 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
RradO88667 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
RradO88667 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RradO88667 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RradO88667 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RradO88667 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
RradO88667 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RradO88667 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RradO88667 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RradO88667 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RradO88667 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RradO88667 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RradO88667 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RradO88667 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RradO88667 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RradO88667 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RradO88667 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RradO88667 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RradO88667 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RradO88667 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RradO88667 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RradO88667 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RradO88667 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RradO88667 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RradO88667 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RradO88667 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RradO88667 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RradO88667 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RradO88667 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RradO88667 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RradO88667 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RradO88667 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RradO88667 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RradO88667 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RradO88667 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RradO88667 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RradO88667 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RradO88667 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RradO88667 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RradO88667 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RradO88667 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RradO88667 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RradO88667 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RradO88667 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RradO88667 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RradO88667 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RradO88667 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RradO88667 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RradO88667 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RradO88667 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RradO88667 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RradO88667 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RradO88667 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RradO88667 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RradO88667 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RradO88667 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RradO88667 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RradO88667 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RradO88667 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RradO88667 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RradO88667 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RradO88667 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RradO88667 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RradO88667 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RradO88667 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RradO88667 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RradO88667 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RradO88667 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RradO88667 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RradO88667 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RradO88667 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RradO88667 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RradO88667 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RradO88667 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RradO88667 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RradO88667 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RradO88667 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RradO88667 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RradO88667 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RradO88667 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RradO88667 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RradO88667 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RradO88667 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RradO88667 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RradO88667 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RradO88667 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RradO88667 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RradO88667 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RradO88667 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RradO88667 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RradO88667 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RradO88667 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RradO88667 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RradO88667 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RradO88667 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RradO88667 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
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