Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX5O60225 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX5O60225 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX5O60225 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX5O60225 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX5O60225 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX5O60225 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX5O60225 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX5O60225 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX5O60225 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX5O60225 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX5O60225 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX5O60225 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX5O60225 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX5O60225 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX5O60225 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX5O60225 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX5O60225 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX5O60225 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX5O60225 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX5O60225 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX5O60225 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX5O60225 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX5O60225 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX5O60225 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX5O60225 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX5O60225 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX5O60225 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSX5O60225 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX5O60225 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX5O60225 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX5O60225 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX5O60225 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX5O60225 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX5O60225 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX5O60225 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX5O60225 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX5O60225 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX5O60225 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX5O60225 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX5O60225 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX5O60225 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX5O60225 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX5O60225 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX5O60225 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX5O60225 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX5O60225 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX5O60225 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX5O60225 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX5O60225 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX5O60225 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX5O60225 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX5O60225 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX5O60225 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX5O60225 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX5O60225 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX5O60225 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX5O60225 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX5O60225 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX5O60225 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX5O60225 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX5O60225 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX5O60225 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX5O60225 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX5O60225 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX5O60225 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX5O60225 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX5O60225 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX5O60225 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX5O60225 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX5O60225 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX5O60225 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX5O60225 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX5O60225 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SSX5O60225 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX5O60225 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX5O60225 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX5O60225 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX5O60225 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX5O60225 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX5O60225 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX5O60225 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX5O60225 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX5O60225 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX5O60225 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX5O60225 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX5O60225 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX5O60225 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX5O60225 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX5O60225 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSX5O60225 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX5O60225 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX5O60225 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX5O60225 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX5O60225 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX5O60225 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX5O60225 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX5O60225 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX5O60225 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX5O60225 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms