Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nck2O55033 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nck2O55033 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nck2O55033 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Nck2O55033 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nck2O55033 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nck2O55033 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nck2O55033 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nck2O55033 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nck2O55033 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nck2O55033 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nck2O55033 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Nck2O55033 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nck2O55033 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Nck2O55033 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nck2O55033 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nck2O55033 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nck2O55033 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nck2O55033 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nck2O55033 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nck2O55033 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nck2O55033 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nck2O55033 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nck2O55033 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nck2O55033 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Nck2O55033 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nck2O55033 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nck2O55033 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nck2O55033 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nck2O55033 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nck2O55033 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nck2O55033 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nck2O55033 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nck2O55033 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nck2O55033 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nck2O55033 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nck2O55033 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nck2O55033 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nck2O55033 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nck2O55033 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nck2O55033 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Nck2O55033 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nck2O55033 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nck2O55033 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nck2O55033 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nck2O55033 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nck2O55033 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nck2O55033 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nck2O55033 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nck2O55033 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nck2O55033 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nck2O55033 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nck2O55033 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nck2O55033 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Nck2O55033 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nck2O55033 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nck2O55033 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nck2O55033 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nck2O55033 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nck2O55033 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nck2O55033 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nck2O55033 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nck2O55033 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nck2O55033 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nck2O55033 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nck2O55033 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nck2O55033 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Nck2O55033 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nck2O55033 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nck2O55033 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nck2O55033 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nck2O55033 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nck2O55033 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nck2O55033 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nck2O55033 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nck2O55033 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nck2O55033 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nck2O55033 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nck2O55033 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nck2O55033 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nck2O55033 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nck2O55033 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nck2O55033 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nck2O55033 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nck2O55033 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nck2O55033 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nck2O55033 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nck2O55033 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nck2O55033 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nck2O55033 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nck2O55033 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nck2O55033 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nck2O55033 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nck2O55033 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nck2O55033 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nck2O55033 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nck2O55033 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nck2O55033 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nck2O55033 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nck2O55033 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms