Protein–RNA interactions for Protein: O54904

B3galt1, Beta-1,3-galactosyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3galt1O54904 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
B3galt1O54904 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
B3galt1O54904 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
B3galt1O54904 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
B3galt1O54904 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B3galt1O54904 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B3galt1O54904 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
B3galt1O54904 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
B3galt1O54904 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
B3galt1O54904 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
B3galt1O54904 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
B3galt1O54904 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
B3galt1O54904 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
B3galt1O54904 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
B3galt1O54904 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
B3galt1O54904 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
B3galt1O54904 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
B3galt1O54904 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
B3galt1O54904 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
B3galt1O54904 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
B3galt1O54904 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
B3galt1O54904 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
B3galt1O54904 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
B3galt1O54904 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B3galt1O54904 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B3galt1O54904 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B3galt1O54904 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B3galt1O54904 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B3galt1O54904 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B3galt1O54904 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
B3galt1O54904 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B3galt1O54904 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
B3galt1O54904 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B3galt1O54904 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B3galt1O54904 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B3galt1O54904 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B3galt1O54904 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B3galt1O54904 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B3galt1O54904 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
B3galt1O54904 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
B3galt1O54904 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
B3galt1O54904 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
B3galt1O54904 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
B3galt1O54904 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
B3galt1O54904 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
B3galt1O54904 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
B3galt1O54904 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
B3galt1O54904 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
B3galt1O54904 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
B3galt1O54904 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
B3galt1O54904 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
B3galt1O54904 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
B3galt1O54904 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
B3galt1O54904 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
B3galt1O54904 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
B3galt1O54904 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
B3galt1O54904 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
B3galt1O54904 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
B3galt1O54904 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
B3galt1O54904 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
B3galt1O54904 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B3galt1O54904 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
B3galt1O54904 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B3galt1O54904 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B3galt1O54904 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
B3galt1O54904 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B3galt1O54904 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B3galt1O54904 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
B3galt1O54904 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
B3galt1O54904 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
B3galt1O54904 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
B3galt1O54904 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
B3galt1O54904 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
B3galt1O54904 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B3galt1O54904 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
B3galt1O54904 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B3galt1O54904 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
B3galt1O54904 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
B3galt1O54904 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
B3galt1O54904 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B3galt1O54904 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B3galt1O54904 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B3galt1O54904 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
B3galt1O54904 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
B3galt1O54904 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
B3galt1O54904 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
B3galt1O54904 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
B3galt1O54904 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
B3galt1O54904 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B3galt1O54904 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
B3galt1O54904 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
B3galt1O54904 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
B3galt1O54904 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
B3galt1O54904 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B3galt1O54904 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B3galt1O54904 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B3galt1O54904 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B3galt1O54904 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
B3galt1O54904 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B3galt1O54904 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms