Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bnc1O35914 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bnc1O35914 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bnc1O35914 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bnc1O35914 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bnc1O35914 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Bnc1O35914 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Bnc1O35914 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Bnc1O35914 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bnc1O35914 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bnc1O35914 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bnc1O35914 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bnc1O35914 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bnc1O35914 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Bnc1O35914 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bnc1O35914 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bnc1O35914 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bnc1O35914 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bnc1O35914 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bnc1O35914 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Bnc1O35914 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Bnc1O35914 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Bnc1O35914 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bnc1O35914 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bnc1O35914 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bnc1O35914 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bnc1O35914 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bnc1O35914 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bnc1O35914 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bnc1O35914 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bnc1O35914 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bnc1O35914 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bnc1O35914 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bnc1O35914 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bnc1O35914 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bnc1O35914 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bnc1O35914 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Bnc1O35914 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bnc1O35914 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bnc1O35914 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bnc1O35914 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bnc1O35914 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bnc1O35914 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Bnc1O35914 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bnc1O35914 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bnc1O35914 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bnc1O35914 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bnc1O35914 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bnc1O35914 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bnc1O35914 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Bnc1O35914 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bnc1O35914 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bnc1O35914 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bnc1O35914 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bnc1O35914 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bnc1O35914 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bnc1O35914 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bnc1O35914 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bnc1O35914 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bnc1O35914 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bnc1O35914 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bnc1O35914 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bnc1O35914 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bnc1O35914 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bnc1O35914 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bnc1O35914 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bnc1O35914 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bnc1O35914 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bnc1O35914 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bnc1O35914 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bnc1O35914 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bnc1O35914 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bnc1O35914 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Bnc1O35914 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bnc1O35914 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bnc1O35914 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Bnc1O35914 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bnc1O35914 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bnc1O35914 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bnc1O35914 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bnc1O35914 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bnc1O35914 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bnc1O35914 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Bnc1O35914 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bnc1O35914 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bnc1O35914 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bnc1O35914 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bnc1O35914 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bnc1O35914 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bnc1O35914 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bnc1O35914 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bnc1O35914 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bnc1O35914 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bnc1O35914 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bnc1O35914 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bnc1O35914 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bnc1O35914 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bnc1O35914 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bnc1O35914 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bnc1O35914 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms