Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RaxO35602 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RaxO35602 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RaxO35602 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RaxO35602 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RaxO35602 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RaxO35602 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RaxO35602 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RaxO35602 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RaxO35602 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RaxO35602 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RaxO35602 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RaxO35602 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RaxO35602 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RaxO35602 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RaxO35602 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RaxO35602 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RaxO35602 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RaxO35602 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RaxO35602 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RaxO35602 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RaxO35602 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RaxO35602 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RaxO35602 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RaxO35602 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RaxO35602 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RaxO35602 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RaxO35602 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RaxO35602 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RaxO35602 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RaxO35602 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RaxO35602 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RaxO35602 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RaxO35602 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RaxO35602 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RaxO35602 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RaxO35602 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RaxO35602 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RaxO35602 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RaxO35602 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RaxO35602 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RaxO35602 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RaxO35602 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RaxO35602 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RaxO35602 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RaxO35602 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RaxO35602 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RaxO35602 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RaxO35602 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RaxO35602 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RaxO35602 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RaxO35602 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RaxO35602 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RaxO35602 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RaxO35602 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RaxO35602 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RaxO35602 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RaxO35602 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RaxO35602 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RaxO35602 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RaxO35602 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RaxO35602 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RaxO35602 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RaxO35602 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RaxO35602 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RaxO35602 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RaxO35602 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RaxO35602 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RaxO35602 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RaxO35602 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RaxO35602 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RaxO35602 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RaxO35602 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RaxO35602 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RaxO35602 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RaxO35602 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RaxO35602 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RaxO35602 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RaxO35602 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RaxO35602 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RaxO35602 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RaxO35602 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RaxO35602 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RaxO35602 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RaxO35602 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RaxO35602 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RaxO35602 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RaxO35602 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RaxO35602 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RaxO35602 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RaxO35602 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RaxO35602 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RaxO35602 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RaxO35602 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RaxO35602 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RaxO35602 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RaxO35602 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RaxO35602 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RaxO35602 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RaxO35602 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms