Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Polr1aO35134 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
Polr1aO35134 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Polr1aO35134 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
Polr1aO35134 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Polr1aO35134 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Polr1aO35134 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
Polr1aO35134 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Polr1aO35134 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Polr1aO35134 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Polr1aO35134 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Polr1aO35134 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Polr1aO35134 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Polr1aO35134 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Polr1aO35134 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Polr1aO35134 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Polr1aO35134 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Polr1aO35134 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Polr1aO35134 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
Polr1aO35134 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Polr1aO35134 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Polr1aO35134 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.98
Polr1aO35134 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Polr1aO35134 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Polr1aO35134 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Polr1aO35134 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Polr1aO35134 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Polr1aO35134 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Polr1aO35134 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
Polr1aO35134 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.96
Polr1aO35134 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
Polr1aO35134 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Polr1aO35134 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Polr1aO35134 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Polr1aO35134 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Polr1aO35134 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Polr1aO35134 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Polr1aO35134 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Polr1aO35134 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Polr1aO35134 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Polr1aO35134 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Polr1aO35134 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Polr1aO35134 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
Polr1aO35134 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Polr1aO35134 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Polr1aO35134 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Polr1aO35134 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.94
Polr1aO35134 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Polr1aO35134 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Polr1aO35134 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Polr1aO35134 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Polr1aO35134 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Polr1aO35134 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Polr1aO35134 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Polr1aO35134 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Polr1aO35134 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Polr1aO35134 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
Polr1aO35134 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Polr1aO35134 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Polr1aO35134 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Polr1aO35134 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Polr1aO35134 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
Polr1aO35134 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Polr1aO35134 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
Polr1aO35134 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Polr1aO35134 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Polr1aO35134 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Polr1aO35134 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Polr1aO35134 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Polr1aO35134 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Polr1aO35134 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Polr1aO35134 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
Polr1aO35134 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
Polr1aO35134 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
Polr1aO35134 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Polr1aO35134 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Polr1aO35134 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Polr1aO35134 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Polr1aO35134 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Polr1aO35134 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
Polr1aO35134 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Polr1aO35134 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Polr1aO35134 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Polr1aO35134 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC39.32■■■■□ 3.89
Polr1aO35134 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Polr1aO35134 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Polr1aO35134 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Polr1aO35134 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Polr1aO35134 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Polr1aO35134 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Polr1aO35134 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Polr1aO35134 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Polr1aO35134 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Polr1aO35134 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Polr1aO35134 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Polr1aO35134 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Polr1aO35134 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Polr1aO35134 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Polr1aO35134 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Polr1aO35134 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms