Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cldn4O35054 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cldn4O35054 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cldn4O35054 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cldn4O35054 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cldn4O35054 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cldn4O35054 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cldn4O35054 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cldn4O35054 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cldn4O35054 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cldn4O35054 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cldn4O35054 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cldn4O35054 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cldn4O35054 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cldn4O35054 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cldn4O35054 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cldn4O35054 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cldn4O35054 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cldn4O35054 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cldn4O35054 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cldn4O35054 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cldn4O35054 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cldn4O35054 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cldn4O35054 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cldn4O35054 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cldn4O35054 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cldn4O35054 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cldn4O35054 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cldn4O35054 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cldn4O35054 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cldn4O35054 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cldn4O35054 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cldn4O35054 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cldn4O35054 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cldn4O35054 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cldn4O35054 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cldn4O35054 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cldn4O35054 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cldn4O35054 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cldn4O35054 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cldn4O35054 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cldn4O35054 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cldn4O35054 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cldn4O35054 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cldn4O35054 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cldn4O35054 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cldn4O35054 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cldn4O35054 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cldn4O35054 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cldn4O35054 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cldn4O35054 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cldn4O35054 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cldn4O35054 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cldn4O35054 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cldn4O35054 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cldn4O35054 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cldn4O35054 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cldn4O35054 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cldn4O35054 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cldn4O35054 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cldn4O35054 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cldn4O35054 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cldn4O35054 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cldn4O35054 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cldn4O35054 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cldn4O35054 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cldn4O35054 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cldn4O35054 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cldn4O35054 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cldn4O35054 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cldn4O35054 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cldn4O35054 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cldn4O35054 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cldn4O35054 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cldn4O35054 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cldn4O35054 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cldn4O35054 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cldn4O35054 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cldn4O35054 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cldn4O35054 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cldn4O35054 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cldn4O35054 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cldn4O35054 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cldn4O35054 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cldn4O35054 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cldn4O35054 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cldn4O35054 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cldn4O35054 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cldn4O35054 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cldn4O35054 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cldn4O35054 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cldn4O35054 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cldn4O35054 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cldn4O35054 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cldn4O35054 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cldn4O35054 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cldn4O35054 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cldn4O35054 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cldn4O35054 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cldn4O35054 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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