Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRPO00591 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRPO00591 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRPO00591 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRPO00591 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRPO00591 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRPO00591 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRPO00591 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRPO00591 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRPO00591 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRPO00591 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABRPO00591 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRPO00591 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRPO00591 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRPO00591 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRPO00591 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRPO00591 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRPO00591 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRPO00591 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRPO00591 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRPO00591 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRPO00591 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRPO00591 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
GABRPO00591 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GABRPO00591 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRPO00591 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRPO00591 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRPO00591 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRPO00591 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRPO00591 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRPO00591 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRPO00591 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRPO00591 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRPO00591 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRPO00591 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRPO00591 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRPO00591 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRPO00591 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRPO00591 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRPO00591 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRPO00591 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRPO00591 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GABRPO00591 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRPO00591 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRPO00591 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRPO00591 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRPO00591 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRPO00591 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRPO00591 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRPO00591 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRPO00591 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRPO00591 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRPO00591 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRPO00591 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRPO00591 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRPO00591 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRPO00591 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRPO00591 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRPO00591 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRPO00591 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRPO00591 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRPO00591 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRPO00591 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRPO00591 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRPO00591 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRPO00591 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRPO00591 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRPO00591 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRPO00591 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRPO00591 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRPO00591 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRPO00591 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRPO00591 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRPO00591 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRPO00591 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRPO00591 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRPO00591 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRPO00591 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRPO00591 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRPO00591 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRPO00591 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRPO00591 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRPO00591 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRPO00591 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRPO00591 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRPO00591 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRPO00591 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRPO00591 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRPO00591 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRPO00591 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRPO00591 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRPO00591 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRPO00591 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRPO00591 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRPO00591 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRPO00591 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRPO00591 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRPO00591 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRPO00591 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRPO00591 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms