Protein–RNA interactions for Protein: F6S200

Plekhg1, Pleckstrin homology domain-containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhg1F6S200 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
Plekhg1F6S200 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Plekhg1F6S200 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Plekhg1F6S200 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Plekhg1F6S200 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Plekhg1F6S200 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Plekhg1F6S200 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Plekhg1F6S200 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Plekhg1F6S200 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Plekhg1F6S200 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Plekhg1F6S200 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Plekhg1F6S200 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Plekhg1F6S200 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Plekhg1F6S200 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Plekhg1F6S200 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Plekhg1F6S200 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Plekhg1F6S200 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Plekhg1F6S200 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Plekhg1F6S200 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Plekhg1F6S200 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Plekhg1F6S200 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Plekhg1F6S200 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Plekhg1F6S200 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Plekhg1F6S200 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Plekhg1F6S200 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Plekhg1F6S200 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Plekhg1F6S200 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Plekhg1F6S200 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Plekhg1F6S200 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Plekhg1F6S200 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Plekhg1F6S200 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Plekhg1F6S200 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Plekhg1F6S200 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Plekhg1F6S200 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Plekhg1F6S200 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Plekhg1F6S200 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Plekhg1F6S200 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Plekhg1F6S200 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Plekhg1F6S200 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Plekhg1F6S200 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Plekhg1F6S200 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Plekhg1F6S200 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Plekhg1F6S200 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Plekhg1F6S200 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Plekhg1F6S200 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Plekhg1F6S200 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Plekhg1F6S200 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Plekhg1F6S200 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Plekhg1F6S200 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Plekhg1F6S200 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Plekhg1F6S200 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Plekhg1F6S200 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Plekhg1F6S200 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Plekhg1F6S200 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Plekhg1F6S200 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Plekhg1F6S200 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Plekhg1F6S200 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Plekhg1F6S200 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Plekhg1F6S200 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Plekhg1F6S200 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Plekhg1F6S200 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Plekhg1F6S200 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Plekhg1F6S200 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Plekhg1F6S200 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Plekhg1F6S200 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Plekhg1F6S200 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Plekhg1F6S200 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Plekhg1F6S200 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Plekhg1F6S200 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Plekhg1F6S200 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Plekhg1F6S200 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Plekhg1F6S200 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Plekhg1F6S200 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Plekhg1F6S200 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Plekhg1F6S200 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Plekhg1F6S200 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Plekhg1F6S200 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Plekhg1F6S200 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Plekhg1F6S200 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Plekhg1F6S200 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Plekhg1F6S200 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Plekhg1F6S200 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Plekhg1F6S200 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Plekhg1F6S200 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Plekhg1F6S200 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Plekhg1F6S200 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Plekhg1F6S200 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Plekhg1F6S200 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Plekhg1F6S200 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Plekhg1F6S200 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Plekhg1F6S200 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Plekhg1F6S200 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Plekhg1F6S200 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Plekhg1F6S200 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Plekhg1F6S200 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Plekhg1F6S200 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Plekhg1F6S200 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Plekhg1F6S200 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Plekhg1F6S200 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Plekhg1F6S200 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms