Protein–RNA interactions for Protein: E9Q271

Wdr17, WD repeat domain 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr17E9Q271 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Wdr17E9Q271 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Wdr17E9Q271 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Wdr17E9Q271 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Wdr17E9Q271 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Wdr17E9Q271 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Wdr17E9Q271 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Wdr17E9Q271 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Wdr17E9Q271 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Wdr17E9Q271 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Wdr17E9Q271 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Wdr17E9Q271 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Wdr17E9Q271 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Wdr17E9Q271 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Wdr17E9Q271 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Wdr17E9Q271 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Wdr17E9Q271 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Wdr17E9Q271 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Wdr17E9Q271 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Wdr17E9Q271 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Wdr17E9Q271 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Wdr17E9Q271 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Wdr17E9Q271 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Wdr17E9Q271 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Wdr17E9Q271 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Wdr17E9Q271 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Wdr17E9Q271 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Wdr17E9Q271 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Wdr17E9Q271 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Wdr17E9Q271 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Wdr17E9Q271 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Wdr17E9Q271 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Wdr17E9Q271 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Wdr17E9Q271 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Wdr17E9Q271 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Wdr17E9Q271 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Wdr17E9Q271 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Wdr17E9Q271 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Wdr17E9Q271 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Wdr17E9Q271 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Wdr17E9Q271 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Wdr17E9Q271 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Wdr17E9Q271 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Wdr17E9Q271 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Wdr17E9Q271 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Wdr17E9Q271 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Wdr17E9Q271 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Wdr17E9Q271 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Wdr17E9Q271 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Wdr17E9Q271 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Wdr17E9Q271 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Wdr17E9Q271 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Wdr17E9Q271 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Wdr17E9Q271 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Wdr17E9Q271 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Wdr17E9Q271 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Wdr17E9Q271 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Wdr17E9Q271 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Wdr17E9Q271 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Wdr17E9Q271 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Wdr17E9Q271 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Wdr17E9Q271 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Wdr17E9Q271 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Wdr17E9Q271 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Wdr17E9Q271 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Wdr17E9Q271 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Wdr17E9Q271 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Wdr17E9Q271 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Wdr17E9Q271 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Wdr17E9Q271 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Wdr17E9Q271 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Wdr17E9Q271 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Wdr17E9Q271 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Wdr17E9Q271 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Wdr17E9Q271 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Wdr17E9Q271 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Wdr17E9Q271 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Wdr17E9Q271 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Wdr17E9Q271 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Wdr17E9Q271 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Wdr17E9Q271 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Wdr17E9Q271 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Wdr17E9Q271 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Wdr17E9Q271 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Wdr17E9Q271 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Wdr17E9Q271 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Wdr17E9Q271 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Wdr17E9Q271 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Wdr17E9Q271 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Wdr17E9Q271 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Wdr17E9Q271 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Wdr17E9Q271 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Wdr17E9Q271 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Wdr17E9Q271 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Wdr17E9Q271 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Wdr17E9Q271 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Wdr17E9Q271 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Wdr17E9Q271 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Wdr17E9Q271 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Wdr17E9Q271 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms