Protein–RNA interactions for Protein: E9Q235

Vmn1r88, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r88E9Q235 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vmn1r88E9Q235 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vmn1r88E9Q235 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Vmn1r88E9Q235 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vmn1r88E9Q235 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vmn1r88E9Q235 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vmn1r88E9Q235 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vmn1r88E9Q235 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vmn1r88E9Q235 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vmn1r88E9Q235 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Vmn1r88E9Q235 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vmn1r88E9Q235 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vmn1r88E9Q235 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Vmn1r88E9Q235 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vmn1r88E9Q235 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vmn1r88E9Q235 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vmn1r88E9Q235 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vmn1r88E9Q235 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vmn1r88E9Q235 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Vmn1r88E9Q235 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r88E9Q235 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vmn1r88E9Q235 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vmn1r88E9Q235 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vmn1r88E9Q235 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vmn1r88E9Q235 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vmn1r88E9Q235 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vmn1r88E9Q235 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vmn1r88E9Q235 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vmn1r88E9Q235 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vmn1r88E9Q235 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vmn1r88E9Q235 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Vmn1r88E9Q235 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vmn1r88E9Q235 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vmn1r88E9Q235 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vmn1r88E9Q235 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vmn1r88E9Q235 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r88E9Q235 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r88E9Q235 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r88E9Q235 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r88E9Q235 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r88E9Q235 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vmn1r88E9Q235 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vmn1r88E9Q235 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vmn1r88E9Q235 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vmn1r88E9Q235 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vmn1r88E9Q235 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vmn1r88E9Q235 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn1r88E9Q235 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn1r88E9Q235 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn1r88E9Q235 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vmn1r88E9Q235 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vmn1r88E9Q235 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Vmn1r88E9Q235 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Vmn1r88E9Q235 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r88E9Q235 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r88E9Q235 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn1r88E9Q235 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vmn1r88E9Q235 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vmn1r88E9Q235 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vmn1r88E9Q235 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vmn1r88E9Q235 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vmn1r88E9Q235 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vmn1r88E9Q235 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vmn1r88E9Q235 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vmn1r88E9Q235 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vmn1r88E9Q235 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vmn1r88E9Q235 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vmn1r88E9Q235 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vmn1r88E9Q235 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vmn1r88E9Q235 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vmn1r88E9Q235 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r88E9Q235 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r88E9Q235 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r88E9Q235 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vmn1r88E9Q235 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vmn1r88E9Q235 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn1r88E9Q235 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vmn1r88E9Q235 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vmn1r88E9Q235 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vmn1r88E9Q235 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vmn1r88E9Q235 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vmn1r88E9Q235 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vmn1r88E9Q235 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Vmn1r88E9Q235 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vmn1r88E9Q235 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vmn1r88E9Q235 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vmn1r88E9Q235 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vmn1r88E9Q235 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vmn1r88E9Q235 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vmn1r88E9Q235 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vmn1r88E9Q235 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vmn1r88E9Q235 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vmn1r88E9Q235 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vmn1r88E9Q235 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vmn1r88E9Q235 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vmn1r88E9Q235 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vmn1r88E9Q235 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vmn1r88E9Q235 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vmn1r88E9Q235 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vmn1r88E9Q235 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms