Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm6880A3KG45 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm6880A3KG45 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm6880A3KG45 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm6880A3KG45 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm6880A3KG45 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm6880A3KG45 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm6880A3KG45 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm6880A3KG45 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6880A3KG45 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6880A3KG45 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6880A3KG45 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm6880A3KG45 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm6880A3KG45 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm6880A3KG45 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6880A3KG45 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm6880A3KG45 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm6880A3KG45 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm6880A3KG45 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm6880A3KG45 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm6880A3KG45 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm6880A3KG45 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm6880A3KG45 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm6880A3KG45 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm6880A3KG45 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm6880A3KG45 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm6880A3KG45 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm6880A3KG45 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm6880A3KG45 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm6880A3KG45 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm6880A3KG45 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm6880A3KG45 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm6880A3KG45 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm6880A3KG45 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm6880A3KG45 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm6880A3KG45 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6880A3KG45 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6880A3KG45 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm6880A3KG45 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm6880A3KG45 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm6880A3KG45 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm6880A3KG45 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6880A3KG45 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6880A3KG45 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6880A3KG45 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6880A3KG45 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6880A3KG45 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6880A3KG45 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm6880A3KG45 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm6880A3KG45 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm6880A3KG45 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm6880A3KG45 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm6880A3KG45 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm6880A3KG45 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm6880A3KG45 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6880A3KG45 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm6880A3KG45 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gm6880A3KG45 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm6880A3KG45 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm6880A3KG45 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6880A3KG45 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6880A3KG45 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm6880A3KG45 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm6880A3KG45 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm6880A3KG45 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm6880A3KG45 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6880A3KG45 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm6880A3KG45 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6880A3KG45 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6880A3KG45 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm6880A3KG45 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm6880A3KG45 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm6880A3KG45 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm6880A3KG45 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm6880A3KG45 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm6880A3KG45 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm6880A3KG45 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm6880A3KG45 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm6880A3KG45 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm6880A3KG45 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm6880A3KG45 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm6880A3KG45 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm6880A3KG45 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm6880A3KG45 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6880A3KG45 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm6880A3KG45 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm6880A3KG45 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm6880A3KG45 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm6880A3KG45 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm6880A3KG45 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm6880A3KG45 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm6880A3KG45 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm6880A3KG45 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm6880A3KG45 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm6880A3KG45 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm6880A3KG45 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm6880A3KG45 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm6880A3KG45 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm6880A3KG45 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm6880A3KG45 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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