Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ambra1A2AH22 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ambra1A2AH22 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ambra1A2AH22 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ambra1A2AH22 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ambra1A2AH22 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ambra1A2AH22 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ambra1A2AH22 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ambra1A2AH22 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ambra1A2AH22 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ambra1A2AH22 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ambra1A2AH22 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ambra1A2AH22 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Ambra1A2AH22 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ambra1A2AH22 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ambra1A2AH22 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ambra1A2AH22 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ambra1A2AH22 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ambra1A2AH22 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ambra1A2AH22 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ambra1A2AH22 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ambra1A2AH22 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ambra1A2AH22 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ambra1A2AH22 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Ambra1A2AH22 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ambra1A2AH22 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ambra1A2AH22 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ambra1A2AH22 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ambra1A2AH22 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ambra1A2AH22 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ambra1A2AH22 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ambra1A2AH22 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ambra1A2AH22 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ambra1A2AH22 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ambra1A2AH22 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ambra1A2AH22 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ambra1A2AH22 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Ambra1A2AH22 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ambra1A2AH22 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ambra1A2AH22 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ambra1A2AH22 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ambra1A2AH22 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ambra1A2AH22 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ambra1A2AH22 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ambra1A2AH22 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ambra1A2AH22 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Ambra1A2AH22 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ambra1A2AH22 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ambra1A2AH22 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ambra1A2AH22 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ambra1A2AH22 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ambra1A2AH22 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ambra1A2AH22 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ambra1A2AH22 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ambra1A2AH22 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ambra1A2AH22 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ambra1A2AH22 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ambra1A2AH22 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ambra1A2AH22 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ambra1A2AH22 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ambra1A2AH22 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ambra1A2AH22 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ambra1A2AH22 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ambra1A2AH22 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ambra1A2AH22 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ambra1A2AH22 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ambra1A2AH22 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ambra1A2AH22 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ambra1A2AH22 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ambra1A2AH22 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ambra1A2AH22 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ambra1A2AH22 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ambra1A2AH22 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ambra1A2AH22 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ambra1A2AH22 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ambra1A2AH22 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Ambra1A2AH22 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ambra1A2AH22 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ambra1A2AH22 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ambra1A2AH22 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ambra1A2AH22 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ambra1A2AH22 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ambra1A2AH22 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ambra1A2AH22 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ambra1A2AH22 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ambra1A2AH22 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ambra1A2AH22 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ambra1A2AH22 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ambra1A2AH22 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ambra1A2AH22 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Ambra1A2AH22 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ambra1A2AH22 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ambra1A2AH22 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ambra1A2AH22 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Ambra1A2AH22 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ambra1A2AH22 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ambra1A2AH22 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ambra1A2AH22 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ambra1A2AH22 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ambra1A2AH22 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms