Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WV48

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WV48 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A087WV48 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A087WV48 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A087WV48 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A087WV48 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A087WV48 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A087WV48 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A087WV48 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A087WV48 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A087WV48 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A087WV48 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A087WV48 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A087WV48 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A087WV48 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A087WV48 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A087WV48 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A087WV48 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A087WV48 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A087WV48 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A087WV48 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A087WV48 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A087WV48 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A087WV48 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A087WV48 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A087WV48 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A087WV48 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A087WV48 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A087WV48 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A087WV48 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A087WV48 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A087WV48 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A087WV48 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A087WV48 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A087WV48 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A087WV48 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A087WV48 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A087WV48 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A087WV48 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A087WV48 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A087WV48 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A087WV48 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A087WV48 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A087WV48 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A087WV48 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A087WV48 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A087WV48 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A087WV48 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A087WV48 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A087WV48 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A087WV48 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A087WV48 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A087WV48 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A087WV48 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A087WV48 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A087WV48 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A087WV48 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A087WV48 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
A0A087WV48 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
A0A087WV48 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A087WV48 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A087WV48 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A087WV48 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A087WV48 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A087WV48 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087WV48 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087WV48 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087WV48 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087WV48 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087WV48 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087WV48 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A087WV48 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A087WV48 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A087WV48 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A087WV48 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A087WV48 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A087WV48 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087WV48 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087WV48 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087WV48 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087WV48 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A087WV48 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A087WV48 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A087WV48 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087WV48 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087WV48 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087WV48 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WV48 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WV48 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WV48 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WV48 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WV48 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WV48 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WV48 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WV48 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WV48 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WV48 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WV48 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087WV48 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087WV48 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087WV48 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms