Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WV48

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WV48 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A087WV48 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A087WV48 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A087WV48 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A087WV48 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A087WV48 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A087WV48 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A087WV48 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A087WV48 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A087WV48 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A087WV48 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A087WV48 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A087WV48 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A087WV48 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A087WV48 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A087WV48 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A087WV48 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A087WV48 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A087WV48 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A087WV48 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A087WV48 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A087WV48 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A087WV48 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A087WV48 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A087WV48 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A087WV48 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A087WV48 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A087WV48 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A087WV48 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A087WV48 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A087WV48 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A087WV48 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A087WV48 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A087WV48 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A087WV48 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A087WV48 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A087WV48 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A087WV48 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A087WV48 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A087WV48 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A087WV48 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A087WV48 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A087WV48 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A087WV48 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A087WV48 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A087WV48 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A087WV48 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A087WV48 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A087WV48 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A087WV48 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A087WV48 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A087WV48 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A087WV48 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A087WV48 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A087WV48 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A087WV48 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A087WV48 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
A0A087WV48 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
A0A087WV48 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A087WV48 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A087WV48 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A087WV48 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A087WV48 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A087WV48 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087WV48 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087WV48 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087WV48 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087WV48 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087WV48 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087WV48 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A087WV48 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A087WV48 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A087WV48 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A087WV48 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A087WV48 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A087WV48 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087WV48 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087WV48 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087WV48 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087WV48 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A087WV48 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A087WV48 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A087WV48 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087WV48 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087WV48 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087WV48 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WV48 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WV48 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WV48 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WV48 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WV48 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WV48 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WV48 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WV48 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WV48 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WV48 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087WV48 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087WV48 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087WV48 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087WV48 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms