Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms