Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP12Q9Y561 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms