Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMED5Q9Y3A6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms